功能性闭经的治疗方法有手术。
子宫性的病因有子宫内膜炎、子宫内膜损伤、子宫发育不全，建议可以通过子宫切除手术、宫腔内放疗等方式进行治疗。卵巢功能不正常引起的闭经，主要是因为性染色体异常，或者是单纯的卵巢发育不全。还有卵巢的功能肿瘤。引起闭经是因为垂体疾病引起的荷尔蒙水平的改变。因此，有闭经的症状一定要先检查一下病因。
对于年轻的女性来说，长期闭经人体是没有正常排卵的，会导致不孕的发生；如果由于精神压力大、过度刺激、焦虑等心理原因导致的闭经，长期闭经会导致抑郁症；如果由于多囊卵巢综合征造成的，不及时治疗，会导致胰岛素功能降低，久而久之发展成糖尿病；若卵巢功能差导致的闭经，会导致女性衰老、性生活障碍等危害。
闭经症很可能是内分泌失调导致，卵巢功能不好排卵不规律，阴道及宫颈炎症病变等妇科炎症，学习或是工作紧张等外界坏境影响心理因素导致等。想从根本上调理卵巢功能，恢复自然健康的月经周期，要及早去医院找精通的中医专家开对症的，对症的中药成药或草药治疗就可以了，中药相对属于自然的药物，尽量不要用激素疗法，以免不适及后遗症。
闭经，是指月经超过三个月不能正常来临的现象，需要考虑内分泌失调多囊卵巢综合征引起，同时也不能排除宫寒的可能的，需要妇科做腹部彩超以及性激素六项，可以中医科查明是虚寒症还是寒湿凝滞，再进行用药。
闭经的症状是会出现肚子轻微的下坠胀痛，乳房胀痛，也会出现心情不舒畅、失眠多梦、神经衰弱的现象，远期表现会引起泌尿生殖道系统方面的问题，容易出现反复的阴道炎症，或阴道干涩、性交困难等。