小儿在腹泻时多少都伴有肠道菌群的紊乱，可服用一些肠道微生态制剂，或肠黏膜保护剂。肠道微生态制剂和肠黏膜保护剂可以帮助缩短腹泻病程，效果良好。婴儿腹泻治疗方法具体还要看孩子的病情。病症重则需要去医院就医。
腹泻婴儿可分为两类，即感染性肠炎和消化不良。首先，你需要去医院做常规大便检查。如果大便有炎症，你应该考虑肠炎并使用抗炎药物来控制感染。如果婴儿年龄较小，且反复肠炎，也应考虑乳糖不耐受或肠道过敏的可能性。
孩子出现腹泻的症状，观察孩子是不是吃了一些寒凉的东西，造成了胃部的刺激，才会腹泻，给孩子进行饮食方面的补充，而且多喝一些热水来对腹部有一个保暖的工作，持续腹泻需要到医院进行这方面的检查，看看是不是肠胃发炎等不良的症状，及时进行治疗。
虚寒腹泻通常仍可用药，经常使用的药是妈咪爱，培匪康也有丽珠肠乐之类的口服。还可以使用蒙石脱散、乳酸菌素片、乳酸菌素颗粒、肠炎宁片等，可以缓解身体不适。
小儿腹泻按其病因分为感染性与非感染性2类，它是一种以腹泻为主要表现的多因素、多病原所致的临床综合征，平时应注意保暖以免感冒。用药期间患者应该注意休息，规律作息，避免熬夜，并且注意保暖，避免着凉，避免吃辛辣、刺激的火锅、冰淇淋等食物，以免影响药效。
小儿治疗腹泻可以服用益生菌，如合生元、妈咪爱，可以改善肠道微生态，也可以服用中药帮助健脾胃。
不能给孩子滥用抗菌药，细菌导致的腹泻才能用抗菌药物，不要滥用收敛止泻的药物，急性期不能用，严重腹泻、呕吐导致脱水、酸中毒，若不及时处理容易有严重的后果，情况严重时要及时到医院治疗。久治不愈的腹泻导致食欲减少，可以煮胡萝卜汤给孩子喝，可以有效缓解腹泻。
儿童按摩对痢疾有很好的疗效。对儿童由于食物造成的损伤，以及由于寒风所致的各种腹泻，都有很好的治疗作用。
儿童按摩是一种治疗痢疾的常用手法。
有一种手法，所有人都很清楚，那就是触碰。就是用手去触摸孩子的肚子。这种肚皮按摩是在肚皮上做一次温柔的触摸。
孩子拉肚子的时候，要顺肠道的蠕动来做爱。
因此要格外留意，小儿拉肚子时，要把握好按摩的方向。若触碰的是反向的，效果会起到反效果，使腹泻加重。