一般来说，包皮内侧起小水泡，通常要考虑以下几个方面的问题：
1、生殖器疱疹：通常生殖器疱疹能够在两周内自愈，不过此病存在极易复发的情况，复发一般病程一周左右。
2、过敏：药物过敏、食物过敏也可能会导致包皮内侧起小水泡，另外，生殖器部位接触某种物质引起的过敏性水泡也是其中一种原因。
包皮内侧起小水泡的患者平时应该注意局部的清洁与护理，勤清洗勤换内裤，保持适当运动，比如慢跑、游泳等，早睡早起，作息规律，适量吃新鲜的水果和蔬菜，并清淡饮食，有利于身体健康。
阴茎内包皮里长了个针孔大的小水泡。如果没有什么症状，也就这么一个继续观察一下，保持阴部清洁，每天用清水清洗一次，清洗时要翻开包皮清洗龟头冠状沟，如果有痒痛症状又有不洁的性生活，是不能排除感染疱疹病毒的。淋球菌感染通常会有脓性分泌物，支原体检测包括人型和解脲原体，这是一组的都需要检测。
包皮长水泡，伴随疼痛，有可能是细菌感染导致的炎症，或者是病毒感染引起的疱疹，可以去医院做一些相关的检查，明确病因之后，及时对症治疗。平时要注意不要有不洁的性行为。
这种症状考虑是局部的炎症感染，病人感染生殖器疱疹的可能性很大或者是过敏引起的身体功能改变，出现这种症状病人应该及时就医诊断治疗，治疗期间避免劳累、饮酒、忌性生活，需要时请使用避孕套。
一般来说，包皮上长的水泡主要原因有生殖器疱疹以及包皮龟头炎，需要根据实际情况进行消除。具体分析如下：
生殖器疱疹是由单纯疱疹病毒感染引起，可以引起包皮水泡，患者可以在医生的指导下使用阿昔洛韦乳膏进行治疗，可以出现消除。包皮龟头炎一般与包皮过长、局部卫生差等因素有关，患者可以在医生的指导下使用碘伏清洗包皮及龟头，然后在医生的指导下口服头孢类抗生素，感染控制后水泡可消失。
此外，如果症状严重应该及时前往医院就诊治疗，以免耽误病情。
