如果是单纯的卵巢囊肿，小于4cm的，可以不用治疗，机体能够自己吸收。如果是大于4cm或者为巧克力囊肿，可以考虑手术或者介入治疗。手术治疗可以剥除囊壁，介入疗法创伤小，但是有一定的复发率。
可以采用手术治疗方法，良性卵巢囊肿的手术治疗，卵巢囊肿切除术，尤其是绝经前多采用此种术式，输卵管卵巢切除术，适用年龄较大或绝经后的，恶性卵巢囊肿的手术治疗，多采取卷地毯式将子宫与肿瘤连同盆腹膜整块切除，也可考虑在腹腔内留置导管，以便术后腹腔内注射化疗药物等使用。
女性患有卵巢囊肿可以适当的饮酒。
一般来说是不建议女性在患有卵巢囊肿时饮酒，因为毕竟酒精对女性身体的刺激性比较大，如果过量饮酒，那么酒精就极有可能会对女性的子宫内膜以及卵巢产生较大的危害，不利于女性子宫的健康。而且过量饮酒本就会造成女性肝脏负荷过大，而且还可能会增加卵巢囊肿癌变几率。所以不建议女性在无必要情况下饮酒。
卵巢囊肿蒂扭转是一种常见的妇科急腹病，大约10%的患者会出现蒂部扭曲。一旦发现，立即进行外科治疗，以切除患者一侧的肿瘤及一侧的附件为主。瘤蒂较大，中心向一边倾斜，其蒂部在突变时可能会出现，而扭转的蒂取取自盆腔的漏斗韧带、卵巢固有韧带及输卵管。临床上常见的临床表现为：体位性变化后，会出现一种突发性的腹痛，并伴有恶心、呕吐、休克等。如果出现该情况，建议患者及时进行治疗。
卵巢囊肿发病的原因可能和其他的慢性疾病一样，是遗传因素与环境因素相互作用的结果，也可能与内分泌紊乱、饮食结构失衡等因素有关。如果在常规的检查中发现卵巢囊肿，患者要去医院做激素六项水平检测，如果激素紊乱就要进行调理。如果没有这种情况，也要注意从饮食习惯、运动锻炼等方面进行调理，或许对减少这种疾病的发生有一些效果。
如果卵巢囊肿比较小，身体没有不适，一般是可以同房的。但对于卵巢囊肿超过5厘米的患者来说，属于比较大、比较严重的情况，通常是需要进行手术治疗的，一般是不可以同房的，否则有可能导致卵巢囊肿破裂或者囊肿蒂扭转，需要及时到医院进行治疗。如果患有的是巧克力囊肿，同房还可能会影响性体验，建议患者先到医院进行规范的治疗。