患有卵巢囊肿，是一定要做手术的，而且越早做风险越小，一般做手术之前都会对卵巢进行一系列的体检，在只能做卵巢不是恶性肿瘤的情况下才会开始做手术，并且做完手术后还会服用一定的药物进行治疗，因为卵巢囊肿具有复发性，所以一般在手术以后三个月以内都要定期服用药物。
中医可以治疗卵巢囊肿，中药用药促进卵巢囊肿的消散或者吸收，在中药治疗卵巢囊肿的过程中，采用攻补兼施的方法，运用平和的扶气之品，配合活血化瘀，要用峻猛的药品，达到攻补兼施，不能攻伐太过的作用。
中药对液性左卵巢囊肿一个治疗30天就可以达到很好的疗效，暂时不必选择手术。卵巢囊肿分成液性囊肿，囊实性囊肿（又称混合性囊肿），浆液性囊肿，粘液性囊肿，巧克力囊肿及皮膜下囊肿（又称畸胎瘤）等类型。首先要就医院Ｂ超诊断中可以鉴别出是什么性质的囊肿。目前保守治疗最有疗效的就是液性囊肿。
如果是良性卵巢囊肿可以采用切除术，如果卵巢囊肿已经是晚期时，为了避免囊肿组织向盆腔和腹腔转移，要尽快的切除原发囊肿。但是，晚期的囊肿已经与卵巢粘黏到一起，并紧贴着盆覆膜，所以需要将整个卵巢全部切除。
可以考虑用保守治疗的方式，治疗期间精神压力不要过大，多注意休息，不能熬夜，养成一个良好的生活习惯。另外，平时也要多注意局部的卫生。要以纯棉宽松透气好的内裤为主。
卵巢囊肿需要治疗1个月时间。最常见的治疗方法主要包括药物治疗和手术治疗的方法，由于药物疗法具有一定的局限性，大部分还是要采用手术的方法进行治疗。如果囊肿直径小于5cm，没有明确症状可以不用管。