发热是肛周脓肿的早期症状，局部会出现红肿并伴有发热现象，常为低热，有时可出现高热。还会有全身倦怠不适，食欲不振，睡眠欠佳等症状。肛周脓肿最主要的症状是疼痛，这种疼痛会非常剧烈，且会逐渐加重，行走不便，端坐受限。
婴儿肛周脓肿初期症状主要是哭闹，接触肛门或排便时哭闹加重。随着脓肿形成，可以见到肛周红色肿块，起初肿块质硬，逐渐肿块中间变软破溃溢脓，形成肛瘘，这时患儿哭闹减少，破溃口会反复溢脓。婴儿肛周脓肿大多发生于腹泻患儿，形成脓肿时间较短，2-3天可以见到肿块。
婴儿肛周脓肿初期症状主要是哭闹，接触肛门或排便时哭闹加重。随着脓肿形成，可以见到肛周红色肿块，起初肿块质硬，逐渐肿块中间变软破溃溢脓，形成肛瘘，这时患儿哭闹减少，破溃口会反复溢脓。婴儿肛周脓肿大多发生于腹泻患儿，形成脓肿时间较短，2-3天可以见到肿块。
抽脓不能将肛周脓肿的情况治好，这种穿刺抽得脓液只是获得诊断的一种方式。而对于肛周脓肿来说，有效的治疗办法是进行切开引流，将脓汁排出，并且要进行脓汁的涂片以及菌培养的测定，针对性的抗感染治疗。
患了肛周脓肿后，在肛门脓肿破溃流脓以前，有不少的会出现类似于感冒的恶寒发热症状。这是由于体内有细菌感染所致，也会出现肛周持续性剧痛，受压或咳嗽时加重，行走不便，坐卧不安，全身感染症状不显，局部检查：肛旁皮肤有明显红肿，伴硬结和触痛，可有波动感。
轻微肛周脓肿需要治疗一至两周左右的。可以理疗、外敷中药或用抗生素作局部注射等方法来进行治疗，也可以每天使用温水在温水中加入生理性质的盐水进行坐浴的治疗，来缓解轻微肛周脓肿的情况。