卵巢囊肿的治疗方式取决于患者年龄，是否恶性，囊肿的部位，体积，大小，生长速度，是否保留生育功能以及患者的主观愿望等因素而定。
卵巢囊肿切除术，年轻患者尤其是绝经前患者多采用此种术式，而尽可能保留正常的卵巢组织；输卵管卵巢切除术，年龄较大（45岁以上）或绝经后患者，可行一侧或双侧输卵管卵巢切除术。如果是恶性囊肿，多数患者就诊时多已达晚期，因此要尽一切可能切除原发囊肿及所能见到的盆、腹腔转移灶，通过放疗、化疗来控制病情的发展。
卵巢囊肿彩色B超、X线检查、腹腔镜等先进诊断技术对卵巢囊肿病变可以早期诊断。卵巢囊肿虽然容易恶变，但只要做到早检查、早发现、早治疗还是可以避免的。去当地正规的三甲医院都是可以得到很好的治疗的。
可以考虑用保守治疗的方式，治疗期间精神压力不要过大，多注意休息，不能熬夜，养成一个良好的生活习惯。另外，平时也要多注意局部的卫生。要以纯棉宽松透气好的内裤为主。
卵巢囊肿需要治疗1个月时间。最常见的治疗方法主要包括药物治疗和手术治疗的方法，由于药物疗法具有一定的局限性，大部分还是要采用手术的方法进行治疗。如果囊肿直径小于5cm，没有明确症状可以不用管。
如果是良性卵巢囊肿可以采用切除术，如果卵巢囊肿已经是晚期时，为了避免囊肿组织向盆腔和腹腔转移，要尽快的切除原发囊肿。但是，晚期的囊肿已经与卵巢粘黏到一起，并紧贴着盆覆膜，所以需要将整个卵巢全部切除。
卵巢囊肿建议在医生的指导下进行治疗，平时吃一些易消化吸收的食物，还要注意保暖，不要受凉，多休息，不熬夜，作息有规律，适当的锻炼身体，提高身体的免疫力，按时做好复查。
