卵巢囊肿手术的费用大概在6000-20000元。卵巢囊肿手术差别除了医院医疗水平差异，主要看患者病情的复杂程度。如果选择微创手术，费用较高，一般的三甲医院需要2万元左右；如果选择传统手术，费用在6000到8000左右。当然，病情轻的要便宜一些。
卵对于体积为5-6厘米且B超显示为囊性或囊实性暗区的卵巢囊肿，可以考虑进行腹腔镜下卵巢囊肿剥除术，具有创伤小、美观、并发症少的优点。对于体积为10厘米以上、B超显示为非囊性暗区的卵巢囊肿，可以进行开腹手术，应完整取出囊肿，避免囊液外溢，刺激盆腹腔而引起不适。
很可能是卵巢巧克力囊肿，因为巧克力囊肿是属于子宫内膜异位症所引起的囊肿，在临床上具有很高的复发性，所以在术后为了避免复发可以打达菲林进行治疗。一般是用药三个月到半年的时间。
卵巢切除手术，这应该是可以治疗好的，手术是彻底治疗卵巢囊肿的方法，药物治疗一般只有控制才能彻底治疗。大多数人不会复发，当然也有少数人会复发，所以术后定期检查，注意休息，保持好心情。
如果卵巢囊肿选择微创手术，在三甲级别的医院做，一旦用腹腔镜，费用至少20000元以上，一般是20000-30000元之间。以下为常见一般公立医院收费参考：卵巢肿瘤是女性生殖器常见肿瘤，有各种不同的性质和形态，即一侧性或双侧性、囊性或实性、良性或恶性，其中以囊性多见，有一定的恶性比例。卵巢囊肿类型不同、治疗方法不同，手术难易程度和术后辅助治疗也存在不同。良性卵巢囊肿治疗费用约几千到一两万块钱不等；恶性或交界性肿瘤，手术范围较大，术后需辅助化疗等治疗方式，费用较高。