钙化灶是由炎症和结核引起，如肺结核在治好后可形成肺部钙化灶，肺部的钙化是人体肺细胞坏死之后产生的一些特殊的变异，有钙化现象证明曾经得过肺炎或结核等疾病，但现在康复了。
颅内钙化灶有生理性和病理性之分，所以是否严重需要具体分析。
颅内钙化灶的病理性钙化，包括脑膜瘤性钙化，血管内皮肉瘤性及恶性骨肿瘤性钙化。以生理性钙化最为多见，是正常钙化，例如松果体区的钙化，大脑廉钙化和脉络丛钙化，床间突旁钙化等。生理性钙化很少，主要病因是、脑血管畸形，少突胶质细胞瘤、结核和寄生虫病，感染性疾病等。如果症状比较严重，需要及时就医检查，排除相关疾病。
肝内钙化灶是B超下显示与结石相似强回声，或者在CT上显示肝内高密度影像。
肝内钙化灶时有出现，肝内胆管结石易混淆；
许多人称之为肝内胆管结石，极可能仅仅是肝内钙化灶。如果没有足够证据说明这些“钙化”不是由胆固醇结晶所致的话。尽管肝内钙化灶和肝内胆管结石均具有类似强回声团和图像，但是钙化灶通常并不导致肝胆管扩张。如果出现黄疸则应考虑到肝硬化或者肝癌等疾病。构成肝内钙化灶病变的原因是多种多样的，其中肝内胆管结石最为多见，肝内的慢性炎症或者外伤，寄生虫侵染肝脏，良性肿瘤及肝内转移瘤出现钙化。其中以肝硬化最为多见。总结肝内钙化灶一般是由于肝实质内细胞炎症之后所产生的瘢痕，亦可为肝内胆管壁局部钙化所致。由于这种原因导致了一些疾病如肝硬化或者肝癌，而这些疾病又往往会出现在肝功能正常时。单纯钙化灶症状不明显，通常不造成痛苦，对人体亦无显著损害，亦无须处理。
是指在肾脏局部出现了高密度影，也就是说钙盐沉积在了肾脏，通过检查彩超或者CT、X线片可以看到局部有高密度影，密度影跟骨骼差不多。其中引起肾钙化灶最常见的原因是肾结石，出现尿酸盐、草酸盐、钙盐在肾脏沉积，就有可能形成肾结石。
钙化灶一般是肺细胞炎症痊愈后形成的。常见的是肺结核。肺结核的肺组织会出现干酪性坏死，机体抵抗力增强或者使用药物好转后肺部的炎症灶会逐渐纤维化钙化。气管支气管炎，肺炎改善后也可以出现局部的钙化，甲状腺功能亢进，钙代谢异常可以引起钙盐沉积，形成钙化灶，钙化灶属于良性的病变对身体没大影响。
肝内的钙化灶，是一种良性的病变，是由于钙质的沉积引起的陈旧性病变，可以化验肝功，病毒DNA定量，如果肝功正常，病毒数量不多，单纯钙化灶是不需要治疗的，这对肝脏功能没有影响，不需要担心，当然，可以定期复查。