卵巢囊肿的治疗方式取决于患者年龄，是否恶性，囊肿的部位，体积，大小，生长速度，是否保留生育功能以及患者的主观愿望等因素而定。
卵巢囊肿切除术，年轻患者尤其是绝经前患者多采用此种术式，而尽可能保留正常的卵巢组织；输卵管卵巢切除术，年龄较大（45岁以上）或绝经后患者，可行一侧或双侧输卵管卵巢切除术。如果是恶性囊肿，多数患者就诊时多已达晚期，因此要尽一切可能切除原发囊肿及所能见到的盆、腹腔转移灶，通过放疗、化疗来控制病情的发展。
卵巢囊肿应该去正规的三甲医院治疗，不要去一些小的门诊或者是药店，卵巢囊肿治疗方法，只有卵巢囊肿非常严重了，才考虑手术治疗，如果是因为身体内分泌失调导致的卵巢囊肿，可以中医治疗。
卵巢囊肿在年轻的育龄期女性中发病率很高，患者一般也没有明显的症状。如果是比较大的卵巢囊肿，患者可能会在下腹部摸到一个包块。一般情况下，卵巢囊肿的诊断主要依靠B超、盆腔C等检查，这些检查不仅可以发现囊肿，还可以判断囊肿的性质是生理性或者病理性，对医生根据患者的身体情况以及病情，制成合适的治疗方案有一定的帮助。
卵巢囊肿可采用卵巢囊肿切除术，输卵管卵巢切除术等手术治疗。可根据患者的囊肿的部位，体积，大小，生长速度，是否保留生育功能等因素而定。恶性卵巢囊肿可术后腹腔内注射化疗药物治疗。
去当地的正规的医院做检查及治疗，囊肿没有特效治疗的，如果囊肿不超过5cm可以不手术治疗的，进行药物保守治疗，可以看中医后服用中药调理，有妇科炎症引起的，需要注意做下妇科检查及白带检查和宫颈检查查看是否异常。
症状有下腹不适感，表现为下腹或骼窝部充胀、下坠感。按腹部而发现腹内有肿物，感觉腹痛，月经出现紊乱，囊肿若发生扭转，则有严重腹痛腹帐、呼吸困难、食欲降低、恶心及发热等。较大的囊肿会对膀胱附近造成压迫，引起尿频和排尿困难。