应根据病原菌的种类及对药物的敏感性，有针对性地选用2～3种药物联合应用，这样疗效较好。待症状完全消失，尿液检查正常，细菌培养阴性后用药应持续7～10天方可停药。另外急性尿道炎期病人应多饮水以增加尿量，对尿道有冲洗作用。
尿道炎饮食治疗可以食用一些含有维生素B多的食物，如蜂蜜，小麦，豆腐，韭菜，肌肉以及新鲜的水果和蔬菜，平时坚持大量饮水肾脏排泄的尿液，对膀胱和尿道起着冲洗作用，有利于细菌的排出，每天大量饮水，2~3小时排尿一次，能避免细菌在尿路的繁殖，可降低尿路感染的发病率。
甲硝唑属于抗滴虫和抗厌氧菌感染的药物，也就是甲硝唑对滴虫以及厌氧菌有效。临床中常见的尿道炎是由于普通的细菌感染所引起，如大肠杆菌，所以甲硝唑对这一部分尿道炎的治疗是无效的。
治疗尿道炎，若是淋球菌感染选用青霉素类或者头孢菌素进行治疗。支原体、衣原体感染选用多西环素、阿奇霉素等进行治疗。在治疗期间需要禁欲，避免通过性生活传染给性伴侣。
治疗尿道炎的关键在于是否有症状。毕竟临床上有多种类型的尿道炎。不仅仅是服用抗炎药物来治疗，如滴虫炎、真菌性尿道炎、淋球菌性尿道炎等。治疗方法必须结合情况来进行治疗，或者先去医院检查一下，然后针对性的治疗。