巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种，主要是子宫内膜移位到卵巢而形成的巧克力囊肿。治疗的方法只有手术或者是绝经疗法来治疗。巧克力囊肿手术以后，为了防止复发，术中会冲洗盆腔，都是用药物让三个月不来月经，来达到预防复发的目的。
有痛经的症状，并且月经不调，不能排除巧克力囊肿，或者子宫腺肌症，去医院做B超检查，看是巧克力囊肿还是子宫腺肌症，如果是巧克力囊肿，做一个可视针吸治疗，把巧克力液抽出来，注入硬化剂，这样巧克力囊肿就会吸收，如果是子宫腺肌症，可以上吉妮环治疗。巧克力囊肿又叫子宫内膜异位症，就是说子宫内膜组织出现在了子宫体以外的地方了。本病的发病机制还尚不清楚。常见的症状是下腹痛、痛经、性交不适和不孕等。有些病人无症状。治疗应根据病人的年龄、症状、病变范围以及对生育要求等情况全盘考虑。
巧克力囊肿术后的饮食是可以吃大蒜的，大蒜里面含有了非常丰富的核黄素，硫胺素等营养成分，具有很好的消积食，加速代谢，杀菌消毒的作用，对于疾病的康复会有很大的帮助作用。但是不宜多吃大蒜，因为大蒜属于辛辣刺激性的食物，会对胃肠道产生刺激。
巧克力囊肿手术之后要注意的，首先是按照医生说的按时吃孕三烯酮，然后按照医生说的时间定期复查肝功能，生活上好好休息一个月，一个月内不能性生活，不能盆浴，不能游泳。还需要注意不要吃冷冻的食物，不要抽烟喝酒，饮食生活规律，多吃蔬菜水果，适当的吃鱼肉蛋，不要吃刺激的食品，少喝咖啡，浓茶饮料。
如果是巧克力囊肿应以清淡为主，食用富含营养的物质，纠正偏食及不正常的饮食习惯，多吃牛奶、菠菜、白菜、油菜、香菇、瘦肉、鸡蛋、鲫鱼、苹果、鸭梨、大枣、花生、黑米等。海鲜类不要食用。
