低位复杂肛瘘疾病容易复发，所以要注意坐时要让肛门处于悬空状态，便后用水清洗肛部，可以在医院买个电动肛门护理包，里面有肛部清洁器帮助便后清洗，肛部药浴盆放在马桶上熏蒸坐浴，坐姿时用肛部支撑垫帮助悬空伤口，促进水肿消退。
便便必须通畅，避免干燥，便后清洗，养成规律排便习惯，饮食清淡，多吃新鲜的蔬菜水果，避免口味较辣刺激以及油腻饮食，戒烟戒酒。对于肛瘘的治疗恢复时间需要看肛瘘的复杂程度，定期复查，换药治疗，请专业大夫检查，了解恢复情况。
低位复杂肛瘘手术在手术过程中，需要提前进行麻醉处理，基本上不会感觉到任何的痛苦，但是在手术之前需要配合医生进行肠镜检查，这时候会感觉到一些痛苦，手术之后前三天基本上是最难受的时候，必要的时候可以口服一些止痛的药物，随后症状就会慢慢改善的。
—般无疼痛感，仅觉肛门口坠胀或坠痛，当脓液引流通畅后肿痛马上减轻。有时可因内口较大，粪便流入管道而引起疼痛，尤其是在排便时疼痛加剧。若外口暂时闭合，脓液积聚，可出现局部肿痛，并可伴发热，畏寒等全身症状；外口破溃脓水流出后，症状可迅速减轻或消失。
肛瘘的症状是反复脓性分泌物的排出，瘘管通畅无炎症常不感到疼痛，只感觉局部发胀不适，行走时加重，如外口封闭，瘘管积脓，则有疼痛，排便时加重。肛门周围皮肤受分泌物刺激常感觉瘙痒。