纤维肠镜比纤维胃镜要晚数年才应用于临床，常用的有68厘米长的纤维乙状结肠镜和140厘米或170厘米长的纤维全结肠镜两种，主要用于大肠的检查，全结肠镜亦可进行部分回肠检查。
腹部没有肿块，结肠方面没有病变，也没有出现原因不明的出血。
异常结果：（1） 肠穿孔; （2） 肠出血; （3） 腹胀; （4） 肠管撕裂伤; （5） 偶有心血管意外。
需要检查的人群：（1） 腹部肿块，需明确诊断者。 （2） 原因不明的便血。 （3） 慢性腹泻，或长期进行性便秘。 （4） 进行性消瘦、贫血，怀疑有结肠病变者。 （5） 钡灌肠怀疑有结肠病变者。 （6） 需要结肠腔内手术、激光治疗者。
不合宜人群： （1） 肠穿孔、弥漫性腹膜炎，或肠广泛粘连者。 （2） 细菌性痢疾活动期。 （3） 直肠、肛管、肛周有急性炎症者。 （4） 严重的心、肺、脑疾病，或身体极度衰竭者。
检查前禁忌：进食。
检查时要求：检查者要认真检查。
检查当日进无渣流质饮食或禁食，检查前2小时清洁洗肠，检查前半小时，安静休息。检查时，病人先取左侧卧位，腹部放松，并曲膝。检查中按医生的要求更换体位。检查中如有疼痛，立即向医生诉说，便于医生安全插镜。
肠出血性大肠埃希杆菌感染，结肠黑变病，短肠综合征，小儿消化道出血，急性出血性坏死性肠炎，肠气肿综合征，小肠肿瘤，胰腺炎，恶心和呕吐，肠道息肉病
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