下消化道内镜检查包括结肠镜、小肠镜检查，由于后者应用较少，设备及技术要求甚高，在此仅讨论结肠镜检查。
（1） 嘱患者穿上开洞的检查裤后取左侧卧位，双腿屈曲。
（2） 术者先作直肠指检，了解有无肿瘤、狭窄、痔疮、肛裂等。助手将肠镜先端涂上润滑剂(一般用硅油，不可用液体石蜡)后，再嘱患者张口呼吸，放松肛门括约肌，以右手食指按压物镜头，使镜头滑入肛门，此后按术者指令缓级进镜。
（3） 遵照循腔进镜配合滑进，少量注气、适当钩拉、去弯取直、防袢、解袢等插镜原则逐段缓慢插入肠镜。特别注意抽吸缩短与取直乙状结肠及横结肠，在脾曲、肝曲处适当钩拉、旋镜，并配合患者呼吸及体位进镜，以减小转弯处的角度，缩短检查的距离。
异常结果：结肠疾病的基本病变，如炎症、溃疡及肿瘤与上消化道疾病有相似之处
需要检查的人群：有腹泻、便血、下腹痛、贫血、腹部包块等症状、体征，原因不明者。
不合宜人群：急性重度结肠炎，如重症痢疾、溃疡性结肠炎及憩室炎等。
检查前禁忌：进食和饮水。
检查时要求：配合医生。
到达回盲部的标志为月牙形的阑尾孔、Y 字形(画盘样)的盲尖皱襞及鱼口样的回盲瓣，部分患者尚可见到鞭虫。在体表可见到右下腹集中的光团。在回盲瓣口尽可能调整结肠镜先端角度，机插入或挤进回盲瓣，观察末段回肠15-30cm 范围的肠腔与粘膜。
乳糜泻，克罗恩病
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