双气囊小肠镜是由一条200公分的内视镜和一条145公分的外套管(overtube)所组成，且两者的远端各有一个气球，此外尚有一个帮浦可控制气球的充气或泄气并监控气压。
通常情况，经口进镜可抵达回肠中上段，经肛门进镜可上达空肠中下段，这样交替进镜可对整个小肠进行完全、彻底的检查，一扫小肠检查“死角”，将小肠疾病的诊断和治疗提升到一个全新高度。双气囊小肠镜克服了胶囊内镜不能直视观察和取活检的缺点，在肠腔内可进可退，发现病变还可以取活检，做标记。
异常结果：出现出血、胰脏炎、穿孔等现象。需要检查的人群：小肠出血病因之诊断及止血;小肠肿瘤和息肉切除或切片;小肠阻塞原因之探查;以染色剂做小肠病兆术前之定位;小肠异物之移除。
不合宜人群： 对年龄较大或有严重心、肺、肝、肾功能不全者不宜使用检查前禁忌：饮水和进食。检查时要求：时间较长，不适者及时报告。
由操作者负责插镜和控制旋钮方向，一协助者负责托镜和插送外套管，另一位协助者进行气泵操作，观察病人，给药，钳取活组织等。在x线透视辅助观察引导下利用两个气囊反复交替固定肠管，使有效长度仅2米的内镜和柔软的外套管完成长达6米的小肠检查。
恶心和呕吐，淀粉样变病的胃肠道表现，溃疡病穿孔，肠伤寒穿孔，后壁穿孔性溃疡，结肠粪性穿孔，溃疡病急性穿孔