治疗肺脓肿的药物主要有青霉素类药物和大环内酯类药物。肺脓肿确诊后要及时进行治疗，首先要用抗生素进行积极的治疗，抗生素要覆盖厌氧菌，比如青霉素、甲硝唑、奥硝唑、克林霉素、林可霉素等，另外还要加强痰培养的检查，可以根据药敏试验更换抗生素。其次要重视痰液的引流，主要有体位引流和化痰的药物，氨溴索、桉柠檬碱、乙酰半胱氨酸等。如果出现高热症状，可以口服一些解热止痛的药物，比如美林、洛索洛芬钠、阿司匹林等。如果病人有休克症状，应进行静脉输液，并应用血管活性药物。
肺脓肿不吸收，一般可用脓肿引流或脓肿穿刺。一般来说，如果肺脓肿患者经过有效对症治疗，病程超过三个月仍不能好转，可根据具体情况选择肺脓肿手术切除。此外，肺脓肿临床上是由多种病原菌引起的肺组织化脓性病变，多发生于青年男性。触发因素多且复杂。在治疗肺脓肿首选的药物一般是由抗生素在进行治疗后一般会逐渐消退，如果没有被吸收，可以通过胸部影像学进行查看。
如果是肺脓肿，可以在CT上看见空洞，空洞里面能看见液体平面，如果是急性肺脓肿的患者，在CT上，除了能看见空洞和液平面之外，患者还会伴有高烧的症状，患者可以进行抗感染治疗，如果是慢性肺脓肿患者，一般情况下只能看到空洞，偶尔会出现液平面，病人不会出现发烧的症状，慢性肺脓肿患者需要手术切除，因为抗感染药物效果不好，因此，建议肺脓肿患者一定要尽早治疗，如果形成慢性肺脓肿，不仅需要手术治疗，还会有长期的抗感染治疗。
肺脓肿的诊断要点是诱发的病因、X线胸片检查等，需要在专业医生指导下结合肺脓肿的情况，选择早发现早治疗的原则及时治疗，结核诱发的病因主要是根据患者日常的生活习惯，例如喝酒或者药物过量使用等方式，查看病情。如果患者出现了肺脓肿，也会伴有咳嗽或者发热的现象。另外结合胸部的影像学检查可以查看胸片，经过判断之后了解病情，肺脓肿通常是肺组织出现坏死之后从而造成脓腔。
肺炎与肺囊肿的鉴别诊断大多数是通过胸片或者是胸部CT检查来进行鉴别，但是两者的疗程和治疗方案是不相同的，所以短时间内需要做出肺炎和肺脓肿的鉴别，鉴别诊断的表现分为二点。第一，症状方面，肺炎和肺脓肿都会出现咳嗽以及高热的情况，但是肺脓肿痰液较多同时还伴有臭味。第二，检查胸部影像学，肺炎的表现为斑片状以及片状湿润性的阴影，而肺脓肿大多表现为空洞影，通过胸部影像检查，可以鉴别两种疾病。