甲状腺内储存的激素足够维持1-2个月，所以碘131治疗后短期内，甲状腺内储存的激素释放入血，出现甲亢症状的加重，随着储存激素的耗尽，甲亢症状逐渐好转。碘131治疗甲亢见效的时间大概1月。半年后，如甲亢没有治好，可以再次行碘131治疗。
近期内可以出现一过性甲减、一过性甲亢或者甲亢复发、放射性甲状腺炎、疼痛等症状，通常都能自行缓解和恢复。远期除永久性甲减外，还有可能对比邻组织如甲状旁腺等造成影响，但较为少见。
甲亢碘131治疗后，注意禁止吃海鲜类食品至少1个月，禁用碘酒2周。一周内不揉搓按摩甲状腺部位。此类患者可食富含蛋白及维生素类食品除海鲜外，如肉、蛋、奶、新鲜蔬菜等。建议避免或少用咖啡、酒精等兴奋类饮料1个月。建议甲亢突眼患者戒烟或尽量减少抽烟。
碘131，属于一种放射性核素，治疗甲亢主要就是破坏甲状腺滤泡，使甲状腺一过性释放增加，破坏甲状腺激素合成和分泌的场所，那么约50%的患者治疗后会出现甲减，需要终身口服药物。
碘131治疗甲亢后需隔离3天，放射性碘131治疗产生的辐射是比较小的，一般通常局限在甲状腺附近，对于周围的影响不大。做完放射性碘131治疗之后，一般的隔离要求是与普通成人接触距离至少要在1到2米以上。而对于孕妇、老人或小孩等特殊人群，要尽量避免接触。
用碘131治疗甲亢需要注意服131碘两小时后才能进食。用药后应注意休息，避免过度劳累、情绪激动，以免诱发甲亢危象。一个月内禁服含碘药物、禁食各类海鲜食品，以免降低治疗效果。