对于甲亢的突眼，要根据突眼的类型和程度进行相应的处理。
甲亢突眼可分为单纯性突眼和浸润性突眼，单纯性突眼是由甲亢引起的交感神经兴奋升高引起的，以眼球轻度突出、眼裂增宽等为特征。侵袭性突眼会出现异物感、胀痛、畏光、流泪、复视、视力下降等，严重时会出现眼球固定、眼睑闭合不全、角膜外露等现象。
对于甲亢突眼最基础的治疗是控制甲亢。大多数病人在甲亢症状缓解后，突眼的症状会自行消失。
失眠是甲亢的一种常见症状。治疗上要树立甲亢能治好的信心，缓解病人的焦虑。并可以服用镇静药，或者吃神经阻滞剂，来减少交感神经的兴奋性。同时积极治疗甲亢，如果吃抗甲状腺药物治疗，甲状腺功能恢复正常，失眠也会随之缓解。
甲亢引起闭经可以吃中药调理月经，中西医结合一起治疗。恢复生育能力，消除多毛。一旦建立了正常的月经周期，就能受孕，一种是药物治疗，另一种是手术治疗，根据自己情况选择合适的疗法的。
甲亢可能会导致甲亢和甲亢性心脏病，甲状腺相关性眼病是由于甲亢患者自身免疫反应所致的慢性多系统损害所致，一般有甲状腺功能的异常，如突眼度增大、眼后的眼肌肥厚、增大等。
治疗甲状腺相关性眼病主要有药物治疗、放射治疗、外科治疗等。另外，还有甲状腺有关的心脏病，这是由于甲状腺功能控制不当而引起的一种心脏疾病，引起心肌肥厚、心慌、胸闷等症状。
甲亢突眼的治疗首先应控制原发病，控制甲状腺功能的亢进，可相应地使用抗甲状腺药物进行治疗。或专门针对突眼可在眼睛局部应用激素冲击疗法。也可以采用免疫抑制治疗方法，诱发球后组织或肌肉的过度反应。再者就是采用局部放疗的治疗方法。