肠炎通常会用一些方法减轻直肠黏膜水肿，口服一些药物，改变肠道的菌群，给予一些益生菌药物。医院肛肠科有些病人，采用把弥散的He-Ne激光导到直肠腔里，做黏膜照射也能够起到很好的治疗作用。
少吃辛辣刺激性的食物，保持规律的生活习惯和饮食习惯。注意保持心情的舒畅。直肠炎是可以治疗的，一般是使用中药保留进行观察，或者是使用复方黄柏叶进行灌肠，然后使用麝香痔疮膏和普济栓赛高，同时尽量避免疲劳熬夜。
直肠炎糜烂比较严重。慢性肠炎，诊断明确，治好才是关键；常见病因是急性胃肠道炎症由于没有治好而导致肠道慢性炎症改变，常因饮食不当、吃点瓜果凉的油腻的，喝点饮料、白酒、啤酒等都会拉肚子，由于反复的消炎和过度治疗导致菌群失调、肠功能紊乱是久治不愈的根本原因；病变部位：回肠比较多见，少部分在空肠部位，小肠炎症病变比较多见，饮食不洁是其常见原因。一定要到大型三甲医院治疗。
溃疡性直肠炎大多与不良的生活饮食习惯和烟酒刺激有关，恢复较慢，治疗后容易复发。如果有溃疡性直肠炎，就应该清淡饮食，尽量少吃油腻辛辣刺激性食物，不要吸烟与喝酒，多喝水，多吃蔬菜和水果，及时到正规医院检查治疗。
异物的损伤，是最常见的病因，一些不消化的异物可以引起直肠粘膜的损伤的，从而导致直肠炎。良性肿瘤恶变，也可以引起直肠炎，比如一般的直肠家族性息肉可以恶变。饮食的原因，高脂肪、高蛋白或者是低纤维素的饮食，与直肠炎的发病有明显的关系。有毒的化学品，比如各种杀虫剂不小心服下以后可以导致直肠粘膜的损伤，引起直肠炎。