先天性心脏病室间隔缺损的治疗原则主要是鉴于室缺有自然闭合的可能，因而对缺损小、年龄小的病儿可随诊观察至2岁-3岁的可以进行手术治疗，对于极小室缺、无症状、胸片、心电图均正常者，可以保守治疗。
一般情况下，婴儿心脏杂音有生理性杂音和病理的心源性杂音。具体情况分析如下：
病理性的杂音主要是由心前区的鼓风状的，如：卵圆孔未闭、房间隔缺损、室间隔缺损等。如果有此类的声音，需要及时进行心脏超声检查，一般属于轻微的先天性心脏病，经过细心的治疗，可以自行关闭。其次，一些孩子会出现生理上的噪音，心脏听诊会出现类似于吹风状的声音，但通常是3级以内的，而且心脏B超也没有异常，不排除是先天性心脏病。
室间隔缺损小于0.1-0.3cm时没有任何临床表现其不需要特殊治疗，在1岁半左右可以自行修复。对于缺损比较严重的患儿采用介入治疗和手术治疗，药物治疗可以积极地防止感染性心内膜炎的发生，也可以防止心力衰竭的发生。进行手术治疗需要择期进行，最佳手术年龄在3岁左。
先天性心脏病室间隔缺损的生存期尚不清楚，这与其损伤的严重程度和处理方法有关。间质缺损比较轻微，只要及时进行手术，基本不会对生命造成任何的损害，其生存期与正常人相当。如果出现严重的房间隔缺损，通过外科手术，患者的心脏机能可以恢复正常，但生存期要比普通人短一些。如果不及时有效地处理，可能导致心内膜炎等并发症，对儿童的生命和寿命造成极大的危害。
先天性心脏室间隔缺损治疗要根据发生的位置和直径的大小来选择下一步治疗方案，包括，心血管内科介入微创手术也就是封堵术，特点就是创伤小、痛苦少、恢复快；心胸外科开胸手术。
先天性心脏病室间隔缺损有可能会引起胸闷，憋气，头晕，晕厥，平时可能抵抗力比较低，很容易反复感冒。心脏供血不足也可能会影响到身体的发育。只要发现有异常，就需要进一步检查，如果确诊是室间隔缺损引起的，必要时考虑手术治疗。