SliceTiming

SliceTimimg用来校正1个volume中层与层之间获取(采集)时间的差异,对事件相关设计的实验尤为重要?我们在按钮窗口中的预处理面板中点击“SliceTimimg”,将出现如下对话框:

Data

点击data并在下面的面板中点击“newsession”,这样在data下会出现“session”的分支项,选中该项并点击面板下方的“selectfiles”,然后用spm文件选择器选择你要处理的数据,最后点击“down”?

选择数据时可以把静息态?数值任务和物理大小任务分为三个session来选(data——newsession——session),也可以作为一个session来选,结果是一样的?

NumberofSlices

我们输入每祯图像的层数,如“32”TR,我们输入重复时间,一般为2秒,我们输入“2”TA,是每祯图像获取第一层开始到获取最后一层图像的时间间隔,我们输入TR-TR/nslice,可直接输入公式,如我们输入“2-2/32”?

Sliceorder

我们输入“1:2:31,2:2:32”?指定层获取顺序的层次序参数是一个含N个数的向量,这里N是每个volume所含的层数?每一个数表示该层在图像(volume)中的位置?向量内的数字排列顺序是这些层的获取时间顺序?如行向量[13579111315171921232524681012141618202224](在Matlab中可表示为[1:2:25,2:2,25])各种扫描类型和输入的层顺序如下:

ascending升序扫描(firstslice=bottom):[1:1:nslices];

descending降序扫描(firstslice=top):[nslices:-1:1];

interleaved间隔扫描(middle-top):fork=1:nslices,round((nslices-k)/2+(rem((nslices-k),2)*(nslices-1)/2))+1,end;interleaved(bottom->up):[1:2:nslices2:2:nslices],如[1:2:25,2:2,25];interleaved(top->down):[nslices:-2:1,nslices-1:-2:1]

ReferenceSlice

我们输入“31”?选择参考层,通常选择nslice/2,如25层时选择13层作为参考层?FilenamePrefix,是指新生成的图像前加何标记,一般采用默认设置?最后点击面板上方的向右的绿色三角即开始运行?

运行完后将会生成一系列a*.img文件,这就是时间校准后的数据?注意很多研究者容易将时间校准和空间校准顺序颠倒,一般的观点是如果图像获取是隔层(interleaved)进行的,如1?3?5?7?9?2?4?6?8?10,则要先进性slicetiming再进行realign,如果图像各层是连续(sequential)获取的,如1?2?3?4?5?6?7?8?9?10,则要先进行realign再做slicetiming?

山穷水尽疑无路，雨脚如麻未断绝。

一起来抠天书吧~