单纯孢疹病毒能够导致患单纯孢疹脑炎（HSE），这是一类致死率极高的感染性疾病。然而，其中的病发机制以及神经损伤的原因研究的并不清楚。HSE患者的常见病征是眶额区以及颞叶区的急性坏死性脑炎。在小鼠以及人类的部分群体中，HSV-1主要感染大脑室管膜细胞，从而导致脑室的侧向扩增。研究表明，在HSV-1感染的后期（尤其是病毒抗体水平已经低于检测水平时），大脑中仍然存在大量的胶质细胞、浆细胞以及淋巴细胞，其中的原因仍不得而知。
HSV-1是一类神经细胞特异性病毒，它能够在三叉神经节细胞中稳定潜伏，而且HSV-1感染的溶源化途径的主要标志是一些潜伏相关基因的表达（LAT）。因此，找到HSV-1感染及潜伏所在的脑区，大脑在受到HSV-1急性感染后的反应以及这些特征对HSE造成的神经损伤后遗症是该感染性疾病的研究主要方向。
由于HSV-1主要针对室下区（subventricular zone）以及室管膜进行攻击，因此这些区域可能会为病毒的潜伏感染提供舒适的环境，这一假说也能够解释HSE患者在“治愈”后仍会出现神经损伤后遗症的现象。针对这一问题，来自奥克拉荷马大学的Daniel J. J. Carr课题组进行了深入研究，相关结果发表在最近一期的《J immunol》杂志上。
首先，作者对小鼠进行了HSV-1感染，并分析了大脑各区域的病毒存在情况。结果显示：病毒主要存在于大脑的边质皮层区域。而在感染2个月之后，作者发现病毒的溶源化基因（LAT）主要表达于室管膜区域。
通过流式分析，作者发现在HSE患病后存活的小鼠中，脑部的免疫细胞表现出活化的特征：微型胶质细胞表面表达MHC-II的水平明显升高；DC的数量也有明显上升。此外，在HSE病愈之后，T细胞主要存在于大脑的室管膜区域。其中，局部的记忆T细胞随着时间的延长不断积累，而室管膜中的Ly6c+ T细胞的数量在感染30天后达到峰值，之后在60天时明显下降。
之后，作者发现在病毒潜伏期间，小鼠室管膜区域ISG的表达出现了明显的下降，这也促进了病毒的存活。
通过体外实验，作者证明了室管膜区域中的 T细胞相比大脑其它区域的T细胞活性有明显的降低。通过流式分析，作者发现室管膜区域的CD8 T细胞表达表达一些抑制性的受体，从而降低其活性。
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