尿毒症主要通过肾脏替代治疗方法来治疗，即血液透析、腹膜透析、肾移植三种治疗方式，重要脏器功能衰竭行替代治疗或移植是最成功、有效的，除了水与电解质代谢紊乱和酸碱平衡失调外，由于毒性代谢产物在体内大量潴留而呈现消化道、心、肺、神经、肌肉、皮肤、血液等广泛的全身中毒症状。
肾功能不全一旦发展到尿毒症期，最有效的治疗手段为肾脏替代治疗，分为透析，肾脏移植两类。其中肾脏透析又分为血液透析，腹膜透析两类。血液透析指通过血液透析机过滤血液，将体内代谢残留的废物、毒素、多余水分清除后再输回患者体内。通过连续不断的血液透析，达到清除体内毒素的目的。
是肾功能不全的话，那么如果是比较轻微的情况下，还是可以选择一些中药的，可以通过肠道排毒的方式进行治疗，那么中药已经是没有什么太好的效果，及早到医院去检查不要错因为这时候肾脏已经没有办法完成基本的功能，即使是吃中药的话，有可能也会加重负担。
比较好的治疗方法是透析或肾脏移植，因各种原因不能进行透析或肾移植的，可以采用保守治疗，包括控制感染、避免导致肾损伤药物的使用、注意休息、避免劳累以及药物的使用。
目前有血液透析、腹膜透析和肾移植三种方法。除了肾移植之外，其他的两种肾脏替代治疗均不能完全替代肾脏的功能，因此透析治疗属于不完全肾脏替代治疗。选择透析治疗时还需要给予药物治疗，以控制和减少并发症，所以相对来说，肾移植是比较好的尿毒症替代治疗方法。
治疗是由于尿毒症是慢性疾病，在治疗过程中不可避免的会出现焦虑、恐惧、抑郁等不良情绪，这时家属应该积极与其沟通，鼓励、疏导，让其树立战胜疾病的信心。给予低盐、低脂、优质低蛋白饮食。