卵巢囊肿是一种良性妇科肿瘤，分为生理型和病理型。
囊肿的常见原因是内分泌失调或长期炎症刺激。如果是巧克力囊肿，可能是子宫内膜异位症或炎症刺激引起的。如果是恶性卵巢囊肿，可能是病毒感染引起的。
大多数生理性卵巢囊肿是由内分泌失调或卵泡未破裂引起的黄体囊肿等疾病引起的。病理性卵巢囊肿可分为普通卵巢囊肿和巧克力囊肿。
生理性的卵巢囊肿多是因为内分泌失调引起的黄体囊肿或是卵泡不破裂等疾病引起的。病理性的卵巢囊肿可以分为普通的卵巢囊肿以及巧克力囊肿，囊肿原因有内分泌失调或者是长期炎症刺激，如果是巧克力囊肿，可能是子宫内膜异位症或者是炎症刺激引起的。
如果检查确定有卵巢囊肿这种疾病，主要是由于个人体内的激素水平代谢，以及局部的卵泡发育异常所致，同时卵巢输卵管炎症也会刺激导致形成炎性囊肿，如果是由于巧克力囊肿，通常是由于子宫内膜异位到卵巢上而形成的，普通的卵巢囊肿可能是由于雌孕激素的刺激导致而形成。
女性都应该了解卵巢是分泌性腺激素和排卵的最重要器官，所以一旦女性身体里内分泌失调，就有可能造成卵巢囊肿的发生身体里面雄激素的产生超过了正常的量，而导致了内分泌系统的紊乱。
卵巢肿瘤是由原体腔上皮细胞发育而成的，它具有向不同类型的苗勒上皮细胞分化的潜力。在输卵管上皮细胞中分化为浆液性肿瘤，在宫颈粘膜上分化为粘液性肿瘤，并在子宫内分化为内膜样肿瘤。卵巢上皮肿瘤有良性、交界、恶性三种类型。交界性肿瘤是一种低水平的恶性潜伏性肿瘤，其上皮细胞增殖、细胞分层增多、核异型和核分裂象增多，且多为间质浸润。