男性生殖腺感染可以吃磺胺类、喹诺酮类、青霉素类、头孢菌类药物。
由于个体差异大，具体用药有所不同，患者在用药期间应注意饮食，避免进食辛辣、刺激的食物。男性在治疗期间，可以遵医嘱使用高锰酸钾溶液进行局部清洗，保持局部卫生，勤换内裤，还应避免性生活。
如果是生殖腺感染，一般建议在医生的指导下应用头孢菌素类、喹诺酮类、大环内酯类药物，这些药物在生育系统中的使用率都很高。常用的抗生素有：多西环素，米诺环素，克拉霉素，阿奇霉素，左氧氟沙星，依诺沙星，莫西沙星，头孢地尼，头孢克洛。服用这些药后，3-5天就能起到很好的作用。
内生殖腺感染吃抗生素类药。
病毒、细菌、支原体等等都会引起内生殖腺感染。外生殖器的逆行感染主要有前列腺炎、睾丸炎、附睾炎、精囊炎等。患者可以在医生的指导下吃盐酸左氧氟沙星片、环丙沙星片等喹诺酮类抗生素。平时要多饮水，尽量不要吃辛辣、寒凉、刺激的东西。
一般情况下，男性泌尿系统感染者可以在医生的建议下，服用头孢菌素、喹诺酮类、大环内酯三类药。
如左氧氟沙星、莫西沙星、环丙沙星、依诺沙星、头孢地尼、头孢克洛、世福素、红霉素、罗红霉素、多西环素、克拉霉素、阿奇霉素等。另外，还可以吃中成药，比如三金片、癃清片等。
男性生殖系统感染吃红霉素、大观霉素、左氧氟沙星等药。
男性生殖系统感染细菌，容易出现尿频、尿急、尿痛等症状，还会伴随尿道口红肿、尿道口有大量的黄色脓性分泌物。淋病一经诊断要及时治疗，首先要用到的是头孢曲松肌内注射，同时还可以服用红霉素、大观霉素、左氧氟沙星等。
男性生殖器被细菌感染后，可能会引起的包皮炎、龟头炎等感染，可出现包皮、龟头红肿、糜烂伴有疼痛等症状，并且可见黄色的脓性分泌物出现。治疗需要使用高锰酸钾溶液进行局部清洗，保持干燥，并且外涂红霉素软膏或者百多邦治疗。也可口服抗生素进行治疗，如头孢克肟胶囊进行治疗。