一般来说，龟头小便会疼主要是以下原因。具体分析如下：
龟头小便疼痛，通常是尿路感染的典型临床表现，主要与细菌、病毒等病原体感染有关，炎症刺激尿道粘膜后，通常会导致局部出现充血水肿的情况，严重者还可能有渗出，从而出现相关症状，并伴有尿频、尿急等症状，患者需要在医生的指导下进行治疗，帮助缓解不适症状。此外，急性细菌性前列腺炎也可能出现龟头小便会疼的情况，同时伴有会阴部疼痛、腰膝酸软等临床症状。
龟头发生疼痛的病症，可以由以下几个原因引起的，龟头疼痛也可能是由于不良的性行为引起的。性生活次数过频，特别是新婚青年由于纵欲过度，使生殖器官长期充血，引起龟头局部肿胀和疼痛。过敏症状也会引起龟头疼痛。要避免刺激抓挠，积极到皮肤科检查的。
首先考虑是龟头炎的表现，由于包皮过长，包茎导致细菌感染出现的炎症反应，一般需要涂抹些抗感染的药膏，对症治疗三到五天，症状能够缓解。如果存在包皮过长，包茎情况，应该做包皮环切手术，才能够预防复发。
一般来说，龟头系带疼可能是以下原因：
龟头是指阴茎前端的球状物，位于阴茎的远端，与阴茎体相连，属于男性身体上的一个较为敏感的部位。龟头系带疼一般需要考虑跟炎症有一定关系，或是龟头系带过短导致的。如果患者有红斑红点、瘙痒疼痛等临床症状，可能与炎症有关系，否则无关，患者应该到医院进一步检查来明确。
患者生活要规律，不要熬夜，多休息,保持充足的睡眠；饮食尽量选择高蛋白的食物；适量增加运动量，锻炼身体，提高免疫力。
龟头小便会疼是尿道感染的表现，由于尿道的炎症刺激尿道粘膜，充血水肿，严重还会有渗出，所以在小便的时候会出现龟头的疼痛，泌尿系统的感染也会出现龟头小便疼痛的症状，同时还会伴有尿频尿急等尿路刺激症状，患有急性细菌性前列腺炎，在小便时也会出现龟头疼痛的症状，同时还伴有会阴部疼痛以及腰膝酸软的症状。
