治疗唇腭裂要进行手术治疗，唇腭的整形手术可能要分多次完成，寄希望于一次手术即可成功是不现实的。唇腭裂要初步诊断病患程度如何，要尽早治疗，按照序列治疗的程序进行治疗。可以利用裂隙邻近组织瓣封闭裂隙，以恢复软腭的生理功能。也可以利用咽后壁组织瓣增加软腭长度，以改善腭咽闭合。唇腭裂疤痕修复手术具体方法是将异位的口轮匝肌复位，恢复肌肉的连续性，达到功能性修复。注意唇裂疤痕修复的正常高度，人中居中，上唇两侧对称。唇裂者常伴有鼻部畸形，应同时矫正鼻小柱偏斜，增加鼻小柱高度，矫正鼻翼塌陷，恢复鼻孔基本对称。
唇腭裂修复手术费用通常在5000到15000元左右。如果是成人病人，唇裂可以选择局部麻醉，手术费用通常在5000元左右。而腭裂手术区域与咽腔相距较近，局麻易引起恶心，呛咳，给手术操作带来不便，影响术后效果，故腭裂手术一般选择全身麻醉下进行，费用较局麻贵，大约在10000元左右。
唇腭裂的费用是没有统一的收费标准的，一般是在万元以上，主要还得根据治疗医院的选择，选择医院的不同，价格也会不同，还得根据唇腭裂具体情况的不同来决定，还有一些医院选择治疗医生的不同，收费也会不同的，这些都会影响收费标准。
唇裂小儿在术后麻醉未清醒时应平躺，头偏向一侧,以免误吸。全麻清醒后4小时,可给予少量流质或母乳。术后第1天就可以去除伤口的敷料，任其暴露,但应束缚小儿双手，防其挠抓创口。术后应给予全身抗生素预防感染，正常愈合的创口5~7天即可拆线，应注意防止小儿跌跤导致创口裂开。情绪稳定：当孕妇出现忧虑、焦急、暴躁、恐惧等不良情绪时，肾上腺皮质激素可能阻碍胚胎某些组织的融汇作用，造成胎儿唇裂或腭裂;营养平衡：妈妈是胎儿率先的营养来源。在怀孕期，均衡而多元化的饮食是非常重要的。怀孕时吃和喝的一切都会对婴儿造成影响，要多吃蔬菜和新鲜的水果，少吃含糖份、盐份和经过加工的食物。
唇腭裂是母亲在生长发育过程中一些不利因素造成的。这些因素可归纳为遗传因素和环境因素两大类，临床实践中经常发现唇腭裂患儿，在其直系或旁系亲属中，也有类似的畸形，这是由于某个基因的突变造成的。环境因素指的是胚胎生长发育的环境。母体是胚胎生长发育的温床，如果母体受到外界的干扰，就会影响胚胎发育。