小肠镜和肠镜的区别就是检查的部位不一样，如果要进行肠镜检查，需要头一天之前服用导泻剂，把肠道清理干净，第2天空腹去医院进行检查，可以检查肠道内壁的结构，对发现的病灶从不同角度观察，甚至去病理组织或者染色等。所以先通过胶囊胃镜大致定位病灶，如果同时能明确诊断那是很好的，如果没看清楚，那么小肠镜进一步明确是必要的。
电子肠镜说的就是肠镜，肠镜检查能看到肠腔内的所有病变，如果这次便血时间长，再做一次肠镜检查，以明确便血原因。肠镜的检查一般主要是检查肠子，主要是检查的部位是不一样的，肛门镜的检查一般考虑是在肛肠科进行，肠镜的检查，需要挂消化内科进行检查的，而且肛门镜的检查，相对比较简单，肠镜的检查相对要复杂一些。
观察部位不同：小肠镜主要观察小肠病变。大肠镜可以观察直肠、乙状结肠、降结肠、横结肠、升结肠，镜头可以插至末端回肠约20-30公分；小肠镜操作费时：大肠长度约1.2-1.5m，小肠长度约5-6m，所以小肠镜检查费时费力，医生操作难度较高，通常需要两只镜子分别从上下插入对接，以达到全方位观察小肠的目的。
肛门镜是专门查看肛门部位病变情况，长度约10厘米左右，最多可达到直肠，适宜该检查的疾病有痔疮、直肠息肉、肛门脓肿等。肠镜长度约100厘米，经肛门进入肠道检查或取病理组织活检，查看的部位较肛门镜多。
肛门镜是专门查看肛门部位病变情况，长度约10厘米左右，最多可达到直肠，适宜该检查的疾病有痔疮、直肠息肉、肛门脓肿等。肠镜长度约100厘米，经肛门进入肠道检查或取病理组织活检，查看的部位较肛门镜多。