一般情况下，亚急性心内膜炎可以采用以下方式进行治疗：
亚急性感染性心内膜炎常在风湿性心脏病及先天性心脏病的基础上发生。患有亚急性心内膜炎，患者可以在医生指导下使用氟康唑、酮康唑等药物进行治疗。病情比较严重的时候，患者还可以采用外科手术的方式进行治疗。平时注意休息，不要过度劳累，不要食用辛辣刺激的食物。
亚急性心内膜炎治疗首选足量足疗程应用相关的药物，用药疗程要长，一般要六周以上。出现亚急性的心内膜炎症状考虑可以用营养心肌的药物同时，注意休息，吸氧治疗，要减轻心脏的负担的，需要定期抽血检查心肌酶谱。
亚急性感染性心肌炎中，最常见的是草绿色链球菌，D组溶血性链球菌（D-)，其中牛链球菌、肠球菌、表皮葡萄球菌比较常见，其它的都是罕见的。因多种传染病或微生物累积而造成的皮肤上的外伤，通常会引起暂时的菌血症。口腔外伤，多见于青霉素杆菌。胃肠道及泌尿路的感染及感染，通常会导致肠内球菌及格兰氏杆菌产生菌血症。
亚急性感染型心肌炎时，以草绿色链球菌为主，肠球菌、牛链球菌、表皮葡萄球菌是引起自体瓣心内膜炎的主要致病菌。有些是罕见的，例如真菌，立克次体和衣原体。肠球菌、革兰阴性杆菌、葡萄球菌、球菌是人造心脏疾病的主要致病因子。在静脉药物成瘾者中，以金黄色葡萄球菌最多，链球菌次之，革兰阴性杆菌及霉菌最多。具体的治疗方式需要遵医嘱，不要延误治疗。
感染性心内膜炎指因细菌、真菌和其它微生物直接感染而产生心瓣膜或心室壁内膜的炎症，有别于由于风湿热、类风湿、系统性红斑性狼疮等所致的非感染性心内膜炎。感染性心内膜炎典型的表现有发热、杂音、贫血、栓塞、皮肤病损、脾肿大和血培养阳性等。
细菌性心内膜炎是部位产生的细菌，侵及到心脏的内膜，从而造成心内膜的炎症。
出现高热、呼吸困难、胸闷、心功能不全的情况，还有就是细菌性心内膜炎会侵犯到心脏的瓣膜，导致瓣膜出现肿块，一旦肿瘤脱离，就会导致肺栓塞、脑血管栓塞、下肢静脉栓塞。
患者需要进行系统的药物治疗，比如：血液培养，药物敏感性测试，选择对细菌敏感的抗生素，持续输入6-8个星期的抗生素，同时要定期检查心脏的彩色超声，看看有没有肿块，如果肿瘤继续增大，不能用药物来治愈，需要立即进行开胸，换瓣，以便早日恢复。
