功能性消化不良可以从日常生活习惯上进行调理，还可以辅助药物调理。
首先在饮食方面可以增加一些有助于消化的食物，同时患者应该保证进食的规律，尽量少食多餐，避免空腹，饭后要适当的运动，促进消化，入睡前要避免再次进食。在生活方面则要保持心情舒畅，规律睡眠，避免过度劳累和压力大的现象。
药物上也可以选择中成药物进行调理，如四磨汤口服液，此药有顺气降逆、消积止痛的功效，对于改善功能性消化不良有一定的效果。
还要注意，如果胃肠出现严重不适，影响日常工作和学习，要及时去医院进行就诊。
儿童功能性消化不良要改正不良的饮食习惯，平时要多注意运动。
儿童在饮食上不要吃高糖、高脂肪的食物，例如奶油、炸鸡等，儿童脾胃比较虚弱，如果吃了这些食物可能会加重肠胃的负担，饮食上可以吃一些易消化的食物，例如胡萝卜、冬瓜、南瓜等，要适当的进行体育锻炼，可以促进肠胃蠕动，提高身体免疫力。
儿童消化不良也可以在医生的指导下服用健脾养胃的药。
儿童功能性消化不良，可以多吃一些高纤维的食物，比如芹菜、玉米等，还可以在医生指导下服用婴儿健脾散、鸡内金等药物调理。
儿童功能性消化不良，一般会出现腹痛、早饱厌食、恶心、呕吐等症状，除了口服药物以外，还可以每天给宝宝顺时针按摩腹部，促进胃肠蠕动，有效的缓解儿童消化不良的现象。
日常生活中饭后可以带孩子进行适当的运动，促进人体对食物的吸收。
一般情况下，功能性消化不良指的是出现上腹痛、腹胀、嗳气、食欲不振、早饱、恶心、呕吐等症状。如果患有功能性消化不良，患者可以口服复方消化酶、乳酶生、复方阿嗪米特、保和丸、枳术丸等辅助消化的药物进行治疗，有较好的治疗效果，建议患者在医生的指导下使用药物进行治疗，以免对身体造成不良影响。患者平时还应注意饮食习惯，避免吃过于辛辣生冷的食物，因保持清淡饮食。
一般情况下，在消化科，功能性消化障碍是一种很普遍的病症，约有50%左右的患者会出现在医院。患者会出现各种症状，有人会出现腹部肿胀，也有人会出现打嗝、嗳气等症状，也有人会出现上腹部疼痛等症状。有些病人，会感觉到肚子里的不适，却又说不上来。功能性的消化障碍一般都是以上腹部胀满、饱胀感、早饱感为主，也就是说，只要稍微进食一下，肚子就会被撑的感觉。还有嗳气，也会有恶心、呕吐等症状，这些都是因为各种原因引起的，建议患者及时去医院就诊，查明病因后对症治疗。
功能性消化不良是指不能以器质性疾病解释而见有持续性或反复发作性上腹部疼痛和食后饱胀、腹部胀气、嗳气、早饱、恶心等上腹部不适症状的一组临床症候群。一般会有溃疡型的功能性消化不良与胃肠型的功能性消化不良，前者比较常见，这种患者常常会出现上腹部的疼痛现象，当然，有的患者也会出现持续性的部位疼痛感觉，而且溃疡性消化不良常常会让患者在饥饿的时候疼痛现象明显加剧，后者常常不会出现明显的疼痛感觉，主要是让患者在吃完饭以后有饱胀感。
常见的判断症状有：1、早饱，指进食后不久就有饱腹感，导致摄入食物明显减少。2、上腹胀，多发生于餐后，或呈持续性进餐后加重。3、一些患者同时伴有失眠、焦虑、抑郁、头痛、注意力不集中等精神症状。在病程中症状也可发生变化，起病多缓慢，经年累月，持续性或反复发作，不少患者有饮食，精神等诱发因素。可以在医生指导下服用药物进行调理。比如四磨汤口服液，此药有顺气降逆，消积止痛的功效，有利于改善功能性消化不良。