卵巢囊肿和子宫肌瘤相对来说卵巢囊肿会比较严重一些，主要由于卵巢囊肿有恶变的倾向。如果身体出现卵巢囊肿需立即进行治疗，如果长时间不治疗会影响患者身体排卵引起不孕，而子宫肌瘤是长在子宫上的实质性肿瘤。卵巢囊肿所包含的病性比较多，如单纯囊肿、巧克力囊肿、肌胎瘤、皮样囊肿等，首先需要立即到医院进行检查来明确具体病情。不管身体出现卵巢囊肿还是子宫肌瘤，还需立即到医院进行检查，结合病情的严重程度来采取进一步治疗措施。
子宫肌瘤和卵巢囊肿严重程度与具体情况有关，较小子宫肌瘤对患者可无任何影响，而较大的肌瘤可能会影响怀孕，同样，生理性卵巢囊肿对患者不造成影响时可无需干预，但如果囊肿增长迅速或有恶变倾向，往往较为严重，需及时处理。
通常情况下，宫颈纳氏囊肿是一种生理变化，一般不需要做什么特别的处理，也不用什么药物，也不用外科手术，但是想要去除这个囊，就必须要做外科手术，将囊内的液体全部清除掉。
因为子宫肌瘤的大小和部位不一样，治疗方法也会有很大的差别，如果是小的，可以口服桂枝茯苓丸，如果是大的，则要做开腹手术，或者是腹腔镜进行检查。
子宫肌瘤卵巢囊肿都是妇科常见的良性肿块。如果囊肿、子宫肌瘤比较小，可以不用处理，但是要定期复查，可以每半年做一次B超复查。如果肌瘤或者囊肿大于五公分，可以考虑采用手术治疗。
子宫肌瘤又称子宫平滑肌瘤，长在子宫体上，一般不会癌变，会随着闭经后子宫的萎缩而萎缩。巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一个表现，子宫内膜异位症在子宫体上称为子宫腺肌症或腺肌瘤，在卵巢上则称为巧克力囊肿。巧克力囊肿不会癌变。
都是良性病变的，都不是太严重的，如果不大，都可以不做处理，注意定期检查就可以的，不过卵巢囊肿不排除是生理性的，这个可以在来经后就会消失的，子宫肌瘤是子宫平滑肌细胞在雌激素或孕激素的刺激下过度增生堆积而成的。自然环境的影响导致基因突变，可发生卵巢囊肿。