输卵管堵塞的病因有很多种，如盆腔的炎症、妇科的炎症等，炎症会造成输卵管粘膜的损伤，从而形成疤痕，从而引起输卵管的狭窄，或者引起梗阻。此外，经期残留的一些物质，比如从子宫里脱落下来的内膜，就会流入输卵管，造成阻塞，甚至是剖宫产后，如果宫腔内的淤血不能及时排出，就会进入输卵管，造成输卵管阻塞。如果是先天性的输卵管狭窄，那么随着时间的推移，输卵管本身就会出现内膜脱落，从而造成输卵管的阻塞。
女性朋友在患慢性盆腔炎后如果没有得及时有效的治疗，会导致输卵管开口，引起输卵管伞端部分或全部闭锁，甚至导致输卵管内层黏膜由于炎症影响而产生粘连，从而导致管腔变窄、闭锁。盆腔粘连：将纤维组织连在一起，在盆腔里，粘连覆盖卵巢、输卵管末端，或将输卵管和组织。
输卵管堵塞，双侧输卵管积水，通常是输卵管炎症引起的。输卵管炎没有得到及时治疗，长时间炎症刺激就有可能会引起输卵管堵塞和输卵管积水的。输卵管堵塞和输卵管积水通常需要做腹腔镜手术治疗，同时还需要用消炎的药物来治疗输卵管炎。
感染大多数输卵管疾病继发于感染，尤其是盆腔炎症性疾病（PID）。感染的其他可能原因包括阑尾穿孔、流产后感染或手术后并发症，如子宫内膜异位症和外科手术造成的炎症状态，由于粘连可导致输卵管的闭塞。
输卵管堵塞的女性自然怀孕是否可以继续妊娠，需要根据受精卵着床位置来决定。如果已经在子宫中正常着床，可以继续妊娠。如果是出现宫外孕，则无法继续妊娠。因为存在输卵管堵塞或者是不通畅的女性，会导致卵子和精子结合的通道出现异常，但并不影响卵子、精子形成受精卵及胚胎的质量。
有可能是妇科炎症引起的，而导致输卵管堵塞的，因为输卵管堵塞多数是慢性盆腔炎导致的，如果没有结核病的情况考虑输卵管堵塞的几率不大，可以在月经干净后的3到7天到当地正规医院行输卵管造影检查，了解输卵管的通畅情况。