川崎病患者大多有较好的预后，部分患者能自行康复。不典型的川崎病，最大的危险在于它会导致冠状动脉的扩张，如果不是这样的话，它是可以自行愈合的。不典型的川崎病也可以通过适当的治疗来恢复。
但也有少数儿童，出现冠状动脉瘤的几率在15-30%之间。要是冠状动脉瘤出现了破裂、血栓、心肌炎之类的情况，那可是要人命的。甚至在康复期间，还会因为缺血性心脏病而突然死亡。如果能够及时发现非典型川崎病，可以在急性期给予阿司匹林或丙种球蛋白等药物，预后较好。
儿童不典型川崎病一般不会自愈。
儿童不典型川崎病一般在临床上可能没有明显症状，此时一般不易被发现，可能会导致病情延误，而病情延误可能会导致病情进一步加重，使患儿错过最佳治疗时机，可能会出现多种并发症。所以儿童不典型川崎病一般不会自愈，需要及时进行治疗，一般可以在医生的指导下及时确诊，进行积极治疗，有效控制病情，避免引起冠状动脉的病变，降低并发症的发病率。
不典型增生和非典型增生是一个意思，结果只是有不典型增生，说明还没有出现癌变，现在已经做手术了，以后应该就不会发生癌变了，还应该定期到医院去复查，半年或者是一年就复查一次。
指上皮细胞异常增生，表现为细胞大小不等，形态多样，排列紊乱，极向丧失。核大深染，核质比例增大，核形不规则，核分裂像增多（不见病理性核分裂像）。细胞具有一定程度异型性，但还不足以诊断为癌。
一般情况下，胃炎肠化轻度不典型性增生，考虑是由慢性胃炎引起的一种炎症。可以通过在医生的指导下按时吃药以及定期复查即可，同时，配合进食面条、小米粥、南瓜粥或香蕉等有利于消化的食物以及避免进食辛辣刺激的食物、戒烟、戒酒等生活习惯进行辅助治疗进行缓解，病情严重时，还可以通过胃镜进行增生切除手术进行治疗，术后仍需要保持饮食健康和细嚼慢咽等，以免刺激胃部引起不适。
一般情况下，胃溃疡不典型增生分为良性肿瘤和恶性肿瘤，不典型增生是癌前病变，但是目前还没有到需要紧急处理的地步，可以暂时不用做外科手术。可以采取奥美拉唑镁肠溶片、枸橼酸铋钾胶囊得乐、阿莫西林等的方法进行保守治疗，同时还要进行常规的组织切片检查。在发生中度和重度的胃溃疡不典型增生时，需要做外科切除。此外，患者应该避免饮酒、浓茶，食用辣椒、大蒜等，通常有助于改善症状。