脑炎患者若有头痛，一般常有全头部和额部疼痛较常见，但究竟是哪一部分，还要根据病人具体病情而定。
对于患有急性脑炎或者亚急性脑炎的患者来说，主要就是由于受到病毒感染而引起的疾病。通常脑炎的病因有多种病原体，如真菌，细菌等、病毒和其他感染引起中枢神经系统的炎性反应，则有些病人常有颅内压升高现象，以头痛、恶心、呕吐为特征的病例。另外一部分患者则是由于其他因素引起脑部受到损伤，例如肿瘤或者外伤等，所以这类病人常常出现额面部和枕部处的胀痛不适，并且持续时间较长。这类病人通常有此额部和全头部胀闷不适较多，然后病人就会由于有了这样的头疼，常使病人产生焦虑和抑郁情绪，影响病人睡眠，头疼的病人这类通常持续时间较长，而有些病人一旦疾病发展，有此持续性症状加剧时，具体哪一个地方疼痛，通常要观察病人病变在什么地方，还要根据病人具体情况而定。
脑炎的头痛并没有一个固定的位置，脑炎全身毒血症状有发热、头痛、身痛、恶心、呕吐、乏力。少数有出血疹及心肌炎表现。神经系统症状表现为意识障碍，脑膜刺激征。可出现颈肌及肩胛肌弛缓性瘫痪，以致头下垂及手臂不能上举，摇摇无依。脑神经及下肢受累少见。瘫痪2～3周可恢复，约半数肌肉萎缩。轻症可无明显神经症状。
对于脑炎的患者来讲，疼痛的部位因人而异。
这种疼痛可能来自整个头部，也可能来自后枕部、双侧颞部和前额。所以并不能根据疼痛的位置来判定是否得了脑炎。脑炎最主要的症状就是痛苦，这与颅内的气压增高以及对大脑的刺激有关。还会有恶心、呕吐等表现。此外，还会导致一些严重的病人出现了认知障碍，从而导致癫痫的发生。老年人要做好脑电图、颅脑核磁共振、腰椎穿刺等检查，明确病因，早期使用抗病毒的药物。
脑炎引起的脑部神经痛的症状，劳累后或是长时间脑力劳动会造成疼痛的症状，属于神经损伤性疼痛。要注意休息，适当多饮水。适当调整好自己的情绪和生活作息习惯，补充营养。
儿童得了脑炎以后会头疼，由于大脑内炎症就会出现水肿，会导致颅内压升高，所以就会出现持续性的头部胀痛。头痛不一定是脑膜炎的表现。头痛主要由头部血管收缩或脑血管痉挛引起，要做出明确的判断。
不会是脑炎，儿童头痛大多为功能性疾病，也就是由于神经心理因素造成的，神经官能症性头痛、多由精神紧张、生气引起，主要症状为持续性的头部闷痛、压迫感、沉重感。建议及早先把孩子的烧退了，然后在进行头疼的治疗，因为总是发烧会引发败血病的。