使用抗感染的药物，用弱效的激素药膏。还可以配合以非激素类的膏，也可以使用抗真菌软膏或者使用一些抗炎症的。同时一定要保持肛门部的清洁，平时排便后要用温水清洗肛门，要勤洗澡，勤换内衣，保持肛门部的清洁干燥。
治疗肛周湿疹也不是很麻烦，肛周湿疹与身体免疫能力的差异有关系，与体质湿热有关，可在治疗肛门周围湿疹药物的同时，在一段时间内继续服用增强机体免疫能力的药物，如果肛门周围湿疹严重，需用碘伏消毒，必须局部清洁干燥。
儿童肛周湿疹可以使用高锰酸钾坐浴，也可以采用红霉素软膏或者莫匹罗星软膏外涂治疗，但是一定要在医生指导下进行，不要擅自使用药物治疗，以免出现不良的反应。
肛周湿疹可能与平时不注意卫生有关，也可能与局部摩擦或者刺激有关。
用药期间一定要保持肛周卫生，勤换洗内裤，避免感染。饮食上要清淡，多吃水果和蔬菜。
给孩子保持肛门周围的干净和清爽，大便之后及时清洗，可以适当使用湿巾来帮助擦拭，可以外擦一些治疗湿疹的药膏。不要让孩子经常去抓挠，以免造成感染，多注意观察。考虑到一般用药，1-2周之后就会有所好转。
外治肛门湿疹在急性期有红斑，大量水泡和渗出时，可用5%硼酸溶液或5%醋酸铅溶液，局部湿敷糜烂结痂时，可用硼酸氧化锌膏或3%糠馏油糊剂外敷也可用肤轻松，强的松龙，皮炎平软膏等涂抹。慢性肛门湿疹。