如果是做的腹腔镜手术，需要住院5-7天的时间。如果做的是开腹手术，需要住院7-9天的时间才可以出院。出院以后一定要定期的复查，因为巧克力囊肿有可能复发，建议每半年做一次B超检查。
囊肿比较大，可以手术治疗的，一般需要住院一周左右。还是休息一个月上班。如果是坐办公室，劳动强度小，可以半个月以后上班。巧克力囊肿是卵巢的子宫内膜异位症。术后必须配合药物产生闭经疗法防止复发。
这样的病症如果是通过手术治疗之后，又复发了，应该查找其复发的原因。可以去检查一下体内的激素水平，看看是不是有这类的原因引起的，如果与此有关，就要调理自己的内分泌状态。
巧克力囊肿手术后不可以不打针的，术后为了预防巧克力囊肿再次复发，所以就需要打针，使用药物来造成女性假绝经，从而使体内异位的内膜完全萎缩坏死。这样才能够达到治好的目的，通常需要打针半年左右。
卵巢巧克力囊肿早期症状表现有性变疼痛：这也是一个明显的信号，可能还伴有点状流血。不正常的经痛：痛经是子宫内膜异位最明显的症状，却是最容易忽略的先兆。没有采取避孕措施也不会怀孕。
巧克力囊肿可以吃鸡蛋。巧克力囊肿是由于子宫内膜异位到了卵巢，是不影响正常的进食的，鸡蛋可以补充蛋白质，有利于组织的修复，可以养心安神，滋阴润燥，对病情是很好的，但是如果有腹泻，发热的症状就不能吃了。对巧克力囊肿也没有直接的不良作用。