必须先去除肛门周围的脓肿，因为肛周脓肿是肛瘘的主要阶段。首先是脓肿切开引流，切口脓肿，切除坏死组织，彻底引流，服用药物，每天局部换药，炎症尽快吸收，形成窦道。瘘管成熟后，可以进行彻底的肛瘘手术。
肛周脓肿可以做收缩肛门的运动，也叫提肛运动。肛周脓肿手术后头几天还是要尽量少运动，多卧床休息。这种运动对于卧床，久坐的白领，久站的劳工等都有好处，平时要注意卫生。
肛周脓肿能完全康复。肛周脓肿的处理原则是切除病变的肛隐窝，尽可能探寻内口所在。切开引流彻底清创暗腔，所有症状可随切开引流而消失。术中选择1点、11点切口，此部位脓肿多见于皮下和括约肌间隙脓肿。脓腔清创引流，脓肿暗腔清除与切除肛隐窝、选择切口有着同等意义，这是过程中的一个非常重要的环节，不容忽视。
复查肛周脓肿去当地正规的大医院咨询后进行检查治疗。要忌辛辣刺激食物，饮食清淡避免便秘，注意肛门清洁卫生，可以便后坐浴，定期医院肛肠科消毒换药，应用消炎药膏等药物，多数需要一月余愈合。
进行了肛周脓肿的手术，将脓肿切开引流后，去除坏死的组织及感染化脓的组织，会造成肛周大面积的创伤，要经过炎症水肿期，肉芽生长期，皮缘生长期三个阶段，大约要4-6周的时间。
肛周脓肿是细菌感染，肛内有原发感染灶，确诊后需要手术治疗，保守治疗只能延误病情。不同地区价钱是不一样的，肛周脓肿所选择的手术方式不同，它的价钱也是不一样的，可以去当地的医院咨询一下。各地区医院医保报销的比例也不同。患有肛周脓肿，平时一定要注意保养，每天要用清水清洗肛门，温水坐浴。平时要多喝水，要尽量避免辛辣和烟酒刺激。少食油腻食物，不要久坐久立。