紧急避孕药中的雌、孕激素对胎儿的性器官发育会产生一定的影响。
避孕药中的人工合成的孕激素可能会使女性胎儿男性化,另外，避孕药中的雌、孕激素作用于胚胎,有可能造成孕妇流产或使胎儿发生畸形。
如果想保留胎儿,可做好孕产期检查（如怀孕14－20周进行唐氏筛查,怀孕22－26周进行彩超排畸检查）,有异常情况及时处理。
如果使用了应急避孕药，出现了避孕不成功的问题，那么这个时候能否生育取决于胎儿的生长状况。孕妇的胚胎在孕期可以正常的生长和发育，但是在分娩的时候会有一些胎儿的异常，一旦发生了异常就必须进行人工流产。但是孕妇一旦出现腹痛、阴道出血等症状，或者是出现了自然流产的情况，则不要生育，否则会对胎儿产生不利的后果。
一般情况下，紧急避孕药会导致女性的内分泌失调，导致经期不正常。不过并不会对日后的妊娠产生任何的负面作用。具体内容如下：
这意味着在使用了紧急避孕药之后，如果不能及时避孕，还是可以怀孕的。应急避孕药中所含的荷尔蒙是普通避孕药的七八倍，一年之内最好不要使用三次。在口服了紧急避孕药之后，可以在三个月内进行检查，等女性的生理期有了新的规律性之后才可以进行妊娠。
建议患者多吃富含维生素、蛋白质等营养物质的食物，如新鲜水果、蔬菜、瘦肉、豆类、奶制品等。
通常情况下，如果在同房后72小时内吃紧急避孕药，怀孕的几率通常较小；如果超出72小时，怀孕的几率较大。
紧急避孕药是一种短效避孕药，一般在同房后72小时吃效果最好，如果患者在同房后72小时内吃紧急避孕药，避孕效果较好，怀孕的几率通常较小；如果患者吃紧急避孕药的时间超出了72小时，可能会影响避孕效果，怀孕的几率较大。
在停药一个月以上可以正常怀孕。紧急避孕药是浓度较高的雌孕激素合剂或者浓度较高的单纯孕激素，用药之后可以改变宫腔内的环境、改变宫颈黏液的性状，从而达到防止怀孕的目的。
紧急避孕药的避孕率虽然高，但也并不能达到百分百避孕的目的。其含有大量激素类物质，会抑制卵巢排卵，避孕效果也受服药时间间隔的影响，如果两次服用紧急避孕药的时间间隔过短也容易造成避孕的失败。