宝宝消化不良可以通过改善生活方式、调整饮食结构、药物治疗等方式来调理。
首先，可以多做游戏和有氧运动，促进肠胃蠕动和消化，改善消化不良。建议每天保持一定的运动量，促进身体发育，促进肠道消化，养成良好的排便习惯。其次，消化不良可能与进食过多、消化不良有关，建议减少进食量，少食多餐，定时定量进食，避免食用辛辣油腻的食物。日常生活中多吃富含维生素、纤维素的水果、蔬菜，如苹果、香蕉、芹菜等，纤维素能促进肠道蠕动，促进肠道的消化。如果长期消化不良，可以口服乳酸菌素片、枯草杆菌二联活菌肠溶胶囊、胰酶肠溶胶囊、神曲消食口服液等药物治疗。儿推拿、中药敷贴、推拿、按摩等也可调理脾胃功能。
小孩消化不良可以通过服用药物、日常护理等方式调理：
儿童的胃肠功能发育不健全，常表现为上腹痛，腹胀，胃气胀，早饱，嗳气，恶心，呕吐，上腹灼热等，这些症状可以长期存在，也可以反复发作，但是没有明显的特点，很少同时发生，多是一种或多种。这些症状会影响儿童的饮食，造成儿童长期缺乏的营养，还会出现儿童的营养不良，还会出现生长缓慢的情况。可以通过服用一些调理胃肠、促进胃肠消化的药物，如妈咪爱、益生菌、妈咪爱等，也可以进行小儿推拿，顺时针按摩宝宝的腹部，可以促进胃肠蠕动，改善消化不良，平时要多吃一些清淡的、柔软的食物，不要吃油腻、寒凉、生硬的食物。
一般情况下，宝宝患有感冒后，可以吃些比较好的清淡软烂食品，比如鸡蛋羹、面条、肉泥等，能够缓解咽喉肿痛、鼻塞等。还可以多食用一些具有润肠作用的香蕉，对缓解消化不良造成的便秘有一定的帮助。如果是因为肠胃不好，会对食物的消化和吸收造成一定的负面作用，建议在进食的时候要注意适量少食多餐，避免过量食用，可能会损伤肠胃。还要注意不要吃辛辣、油腻的东西，否则会引起胃肠不适，从而会加重病情。
一般情况下，小儿消化不良，可以艾灸神阙穴、身柱穴中脘穴。
如果孩子有出现食欲不振、恶心、呕吐、积食等消化不良引起的不良反应，可以通过艾灸来调节孩子的肠胃。通常可以艾灸神阙穴、身柱穴，还可以灸中脘穴，一般在上腹部正中线，在胸骨和肚脐之间，艾灸这个穴位可以缓解消化不良、恶心、呕吐等消化系统病症，能够促进身体恢复。
婴幼儿胃肠不好的时候，添加辅食时还应当注意。应当由少到多，由稀到稠，由淡至浓，逐渐增加。辅食一般可以选择苹果，山楂，西红柿，酸奶等，可以加工成蒸苹果泥，山楂蜂蜜水，西红柿鸡蛋汤等喂养宝宝。
可以吃苹果，苹果既能止泻，又能通便。其中含有的合适药物、有机碱等物质具有收敛作用，所含合适药物可吸收毒素。对单纯性的轻度腹泻，单吃苹果可止泻。苹果中含纤维素可刺激肠蠕动，加速排便，故又有通便作用。