慢性扁桃体炎的危害主要是会导致肾病、全身性疾病，甚至会出现淋巴瘤。
慢性扁桃体炎很容易会使咽部出现分泌物，而且还不容易咳出。炎症可向周围扩散，最常见的是扁桃体周围脓肿；向上可引起急性中耳炎、鼻炎、鼻窦炎；向下引起急性喉炎、支气管炎、肺炎等。扁桃体肥大导致睡眠时呼吸障碍，如果同时有腺样体肥大，会出现打鼾，严重时有憋气缺氧，睡眠不安。
慢性扁桃体炎可以去医院的耳鼻咽喉科进行检查就诊，要结合临床症状，专科检查，辅助检查来明确诊断以及有无手术指征。
儿童患有慢性扁桃体炎症，一般会出现咽喉疼痛、口臭、扁桃体肿大等症状。
儿童患有慢性扁桃体炎症也会导致身体出现一些消化不良、头痛、四肢乏力、容易疲劳、低烧等症状。所以，日常生活中要注意口腔卫生，睡觉前要刷牙，饭后饭前要漱口，尽量避免细菌在嘴里滞留，可以用淡盐水漱口。所以，在没有出现严重症状的情况下，不要使用抗生素。另外，还可以通过运动来提高身体素质，达到外科治疗的适应症后再进行外科治疗。
慢性扁桃体炎主要临床症状有，咽喉部不适，咽喉肿痛，有异物感，发干、发痒，口臭，扁桃体肿大，刺激性咳嗽等。慢性扁桃体炎为腭扁桃体的慢性炎症，是耳、鼻、咽、喉、头、颈外科临床上常见的多发病。
小孩慢性扁桃体炎的主要症状就是扁桃体炎上有白点。
若合并扁桃体附近脓肿要手术治疗，慢性扁桃体炎的症状主要是咽痛反复发作，有口臭、神经反射失调的现象，咽部有异物感，咽部疼痛，阵发性咳嗽，扁桃体明显肿大时会有吞咽困难、说话不清、消化不良、头痛、四肢乏力、容易疲劳、低热等症状，要根据病因制定合理的治疗方案。
慢性扁桃体切除后对身体没有太大影响，由于慢性扁桃体炎反复发作以免引起风心病，但是由于它是一个淋巴器官没有了它的防护作用病原体可能会直接作用于肺部导致肺炎。需要进行生活护理。
小孩有慢性扁桃体炎可以采用手术的方法，也可以采用局部外用药物治病，临床上治扁桃体炎的传统方法比较多，有扁桃体隐窝冲洗法，扁桃体内药物注射疗法，激光疗法，局部喷药等方法。