脚趾上长了水泡首先明确引起的原因，对症治疗，具体如下：
1.如果是真菌感染导致的，可以使用盐酸特比萘芬乳膏等药物涂抹；
2.如果是湿疹诱发的，可涂抹炉甘石洗剂缓解瘙痒症状，同时可配合使用糠酸莫米松乳膏进行治疗。
3.过敏引起可以口服氯雷他定、西替利嗪等抗过敏药物。
注意脚部卫生清洁，注意保持干燥，选择透气性好的鞋袜。
一般来讲，脚趾上水泡的消失取决于疾病的具体情况，通常具体病因有以下几种：
1.持续肢端皮炎。会有小水泡、脓泡、结痂，从黄豆到米粒不等。可以在医生指导下服用复方甘草酸苷胶囊。病情较重的患者，可以口服复方甘草酸苷注射液，外用卤米松软膏、糠酸莫米松软膏等。
2.如果患有足癣，除了脚趾上有水泡，还会出现指甲浸渍、发白的症状，可以选择使用联苯苄唑乳膏或盐酸阿莫罗芬乳膏。
考虑是脚癣，俗称脚气，这是一种真菌感染性皮肤病，具有传染性，尤其是与别人混穿鞋子的情况，发病多见于高温高湿的季节，主要表现是脱皮瘙痒，严重的出现水泡或者糜烂，建议平时少吃辛辣刺激性食物，多吃水果青菜，穿宽松透气的鞋袜。正确的方法是采用洗剂，同时注意保护创面，避免水洗和使用肥皂。
水泡可以被挑破的，不过挑破后需要在伤口处涂上一些抗感染类的药膏，以免出现感染。也可以口服一些药物预防感染，加速伤口的愈合，水泡挑破后一周左右就可以恢复。
脚底长水泡是因为脚底出汗过多，细菌不断感染发炎，是捂的比较热，鞋子不透气的原因引起的，可以注意保持清洁干燥，鞋子的透气性要好，同时要注意不要捂的太热了，多进行曝晒鞋子，平时不要穿透气性差的鞋子。
以用消毒针来进行穿刺治疗，做好消毒，不要感染了，到正规医院进行治疗。可以通过服用口服药的方式来减轻症状，譬如说服用抗菌类口服药。但是鉴于这类药物必须渗透到甲板处才能有效杀死里面的真菌，并且药物在水中的溶解度较低，吸收较慢，因须长时间服用药物才好。