新生儿刚出生时一般是有抗体，并且这种抗体通常会持续到2岁。新生儿具有的抗体主要是针对普通的病毒、细菌等，以及一些疾病，主要属于儿童对病原体的自然免疫能力，一般情况下新生儿是不会生病的。但是新生儿虽然天生具有抗体，可以抵御某些疾病，但也要注意做好防护，毕竟抵抗力是有限度的。如果家长不注重新生儿身体健康的防护工作，也会导致疾病。
新生儿吸入羊水会导致缺血缺氧性脑病和新生儿吸入性胃炎，新生儿如果有羊水吸入的现象，会出现有憋气或者嘴唇青紫的症状，会引起呼吸道感染，呼吸不畅，严重时会引起窒息甚至死亡。
新生儿都会有黄疸的问题的，如果是生理性黄疸，会自动退的，不需要太担心。如果是病理性的黄疸，就需要去医院治疗的。小儿退黄可以采用蓝光照射，促进胆红素尽早从体内排出。要及时治疗，以免过高胆红素有可能会对脑细胞产生损伤。平常也可以多带宝宝晒晒太阳，是早上晒，不要直射宝宝的眼睛。
新生儿在打完卡介苗后2周左右的时间，针眼处会出现局部红肿，伴有硬结。有的新生儿可能会出现化脓，破溃的现象，范围小都是不需要处理的，这是注射卡介苗后特有的反应，是正常的现象，家长注意局部皮肤护理，保持清洁卫生，避免感染，避免穿脱衣物的摩擦，大约在8～12周的时候会形成结痂，结痂脱落后会有一个永久性的瘢痕。
新生儿腹腔囊肿主要是由于胎儿在怀孕的时候受到了不良的影响而导致的。新生儿腹部囊肿通常不会出现症状，可以在产前检查或出生后进行身体检查。主要考虑的是肠系膜囊肿、梅克尔憩室、肠重复畸形等，以及某些恶性病变。通常需要做外科手术，根据病理检查判断是否为良性或恶性。如果能及早发现并及时进行手术，则其预后良好。
新生儿时期接种预防针以2种为主，乙肝疫苗及卡介苗针。
孩子生下来以后在分娩室或者手术室打维生素k1主要是为了防止流血。乙肝疫苗在出生后24小时注射，第2针注射时间为出生后第30日，第3针注射时间为第3个月。
卡介苗针用于防治结核病，通常可在出生后24小时内注射，至迟在三个月内注射。如新生儿时期存在疾病因素而没有接种卡介苗的，三个月后去接种站打针均可。
