幼年特发性关节炎，总体预后较好，适当处理后75%的患者不会严重致残，并发症主要是关节功能丧失和虹膜睫状体炎所致的视力障碍，但是，就个例而言，预后难测，有些人在历经数年缓解后，在成人期，偶尔也会出现复发，有人就认为类风湿因子阳性滴度越高，预后越差。
幼年特发性关节炎，总体预后较好，适当处理后75%的患者不会严重致残，并发症主要是关节功能丧失和虹膜睫状体炎所致的视力障碍，但是，就个例而言，预后难测，有些人在历经数年缓解后，在成人期，偶尔也会出现复发，有人就认为类风湿因子阳性滴度越高，预后越差。
幼年特发性关节炎彻底治愈较难，一般患者停药之后，将来还是有可能复发，复发的原因往往是因为病人依从性不好，也有患者认为药物治疗的副作用较大，自动停药等；幼年特发性关节炎患儿治疗后虽然有可能复发，但在未复发时可以和正常人一样学习、工作。
川崎病是一种自限性的疾病，大部分病人的预后都很好。
一般只有1%-2%的儿童会发生川崎病的复发，而那些没有发生管状动脉病变的孩子，一般会在1个月、3个月、6个月、1-2年进行一次全面的身体检查，包括身体检查、心电图、超声心动图等。如果没有得到有效的治疗，约15%-25%的儿童会患上冠状动脉瘤，因此，应该在6-12个月内进行长时间的跟踪。冠状动脉瘤在发病后2年内会自行消失，但仍会出现血管壁增厚、弹性减退等功能障碍。较大的动脉瘤往往难以完全消退，经常会造成血栓和官腔狭窄。
一般情况下，婴儿川崎病的诊断要根据其临床症状来判断。具体分析如下：
1、会有持续高烧，并且对抗生素的治疗也不是很有效；
2、发烧，会有全身的红疹，嘴唇附近的粘膜破裂，还有一种叫做“杨梅”的舌头。一些孩子也会有红眼病、颈淋巴结有显著增大。一般的感染一般不会有血沉的现象。其它试验缺少特异性症状。川崎病的诊治要考虑多种因素。
