如果输尿管结石小于0.4厘米，一般多喝水，多运动，可以自行排出体外的。0.4-0.6厘米的结石一般很难自然排出体外的，可以通过药物排石，还可以通过一个体外冲击波碎石的方法，将结石击碎，然后多饮水，多运动，就可以排出体外的。另外一厘米以上的输卵管结石，是可以手术来进行处理的。
对于右侧输尿管结石治疗的原则是要及时的取出结石解除梗阻通畅，尿液引流缓解临床症状，减少肾功能的损害。可以通过体外冲击波碎石或者是输尿管镜碎石、取石手术等进行治疗。
需要口服一些药物来进行治疗，因为输尿管结石引起的尿血主要是由于输尿管结石与输尿管黏膜发生摩擦，从而导致输尿管黏膜的小血管破裂出血，从而导致病人尿血。
肌注止疼药加解痉的药物，解除输尿管痉挛，如还不能缓解，可以通过双猪尾管进行治疗。输尿管结石最常见的症状就是疼痛，具体包括腰痛、腹痛等。这时应及时到医院进行治疗，因为吃一般的止疼药是不能解决问题的，应肌注止疼药加解痉的药物，解除输尿管痉挛，这样才能缓解疼痛。
可以保守治疗和微创手术治疗，解除病痛，保护肾脏功能，防止结石复发，输尿管结石是最常见的上尿路结石，多发生于中壮年，男性多发，在泌尿系结石中，大约20%位于输尿管，其中70%位于输尿管下段。
如果是输尿管结石引起梗阻，则可以进行排石治疗或者手术取石。如果是输尿管肿瘤，则需要进行手术治疗，炎症需要进行抗菌消炎治疗。输尿管狭窄可进行扩张或者输尿管支架植入，行球囊扩张以及手术治疗。