女性支原体、衣原体可以通过药物进行治疗。
妇科支原体、衣原体感染一般都是用一定量的抗生素进行治疗，一般情况下可以将其分离出来，然后进行药物敏感性测试，以确定哪些抗生素比较敏感，然后进行相应的治疗。常用的抗生素有红霉素、阿奇霉素等。对于支原体、衣原体等，一般不能使用其他的广谱抗生素。
大多数由衣原体引起的肺炎都需要使用抗生素，如阿奇霉素或红霉素。支原体、衣原体感染所引起的肺炎在临床上主要表现为痰少，干咳，而且在夜间比较明显，有些患者还会出现头痛咽痛的现象。这种疾病比较常见于青少年和儿童在成年人群中是比较常见的。这种疾病主要是通过X线影像学进行检查作出的判断。在进行治疗期间，还应该谨遵医生嘱托，不用药物，不要擅自用药，避免对身体的健康造成影响。
支原体、衣原体感染一般不需要太担心。对于支原体、衣原体的感染，目前最主要的方式就是抗感染治疗，抗感染治疗一般选用大环内酯类的药物，对于一部分症状比较轻的患者，也可以不治疗。因为支原体衣原体的感染具有自限性，适当使用抗感染的药物，可以明显缩短病程减少并发症。
在初起时为散在性的小而细嫩顶部呈尖形的淡赤色疣状丘疹，以后日趋增大增多，长成乳头样、菜花样，呈白色、淡赤色或污灰色，相貌湿润，伴有瘙痒和施压感，这就属于尖锐湿疣的早期症状表现。治疗的关键也在于去除感染的病毒。到专业正规的公立医院进行全面的检查，确定自身感染的病毒型号，做针对性的病毒清除。
霉菌性阴道炎是由念珠菌引起的一种常见多发的外阴阴道炎症性疾病。对单纯性外阴阴道念珠菌病选择局部用药为主，一般用药后2-3日症状减轻或消失。每天保证充足的睡眠，不要熬夜，注意把握好性生活频度。
支原体衣原体尿道炎，是一种慢性的尿道炎，治疗时需要的时间会相对长些，一般而言，对衣原体感染有效的药物对支原体感染也有效。必要时，可采用四环素类药物、大环内酯类药物等治疗生殖道支原体感染，疗程为1～2周。治疗前要先到正规医院去做药敏试验，确定患者对哪一种药物敏感后，再采用敏感的药物进行治疗，治疗期间清淡饮食，避免辛辣刺激、油腻食物，多喝水，注意休息，避免劳累。会阴部要经常清洗，期间不要同房。
