首选的治疗方法就是使用无乳糖配方的奶粉也就是腹泻奶粉等这个孩子腹泻症状缓解以后，慢慢的转化为普通奶粉。当然，如果孩子腹泻的症状比较轻，并且不吃奶粉，只能给孩子吃母乳了，在吃母乳的同时，需要添加乳糖酶的。尽可能多给孩子吃一些不含乳糖的配方奶、豆制品、谷类、麦类的食物。
想检测婴儿是否存在乳糖不耐受，可以通过检测孩子的大便，可以考虑有乳糖不耐受的情况，乳糖不耐受是由于体内缺乏乳糖酶，所以乳糖不能够被正常的消化吸收，就会出现肠鸣腹痛、腹泻、不舒服等症状，长期下去不利于宝宝的生长发育。
需要调整饮食，先用无乳糖配方乳包括以牛乳为基础或以大豆为基础的无乳糖配方乳，待腹泻停止后再根据耐受情况，逐渐增加母乳喂哺次数，改用母乳和无乳糖配方乳混合喂养。
新生儿乳糖不耐受是可以治疗好的。新生儿乳糖不耐受，要带大便到医院检查一下粪便酸性测试和大便常规。如果酸性测试阳性，而且大便常规没有任何异常，考虑是新生儿乳糖不耐受，再考虑以下的处理办法。
肛周囊肿，不宜多吃红薯，红薯味甘、性平、微凉，入脾、胃、大肠经；可补脾益胃，生津止渴，通利大便，益气生津，润肺滑肠，对于防治便秘有一定的疗效，食用时需注意一次不宜食用过多，以免发生烧心、吐酸水、肚胀排气等不适；另外胃溃疡、胃酸过多时也不能食用，其他时间可以放心食用。
新生儿乳糖不耐受症状，出现腹部紧张，胀气，肚子咕咕响，频繁排气，哭闹，恶心，腹泻，严重者会出现呕吐，便血。有的新生儿会出现尿布疹，湿疹，乳糖不耐受得不到治疗和改善，会影响生长发育。