一般情况下，卵巢囊肿是可能会复发的。
卵巢囊肿的手术分为囊肿剔除术和卵巢切除术，如果患者在手术时选择的是囊肿剔除术，手术后体内有残留的囊壁，手术未切除干净，且手术后不注意护理，就可能会复发。有的患者除了患有卵巢囊肿，还合并有肾囊肿、肝囊肿，也可能会复发，且复发率可能会比较高。建议患有卵巢囊肿的患者应及时在医生指导下进行治疗，以免影响身体健康。
卵巢囊肿一般是内分泌失调引起的，属于良性病变，生长缓慢，如果小于三个厘米，考虑是生理性的，可以先观察，暂时不用药物治疗，可以等月经干净以后复查看是否消失，只要是没有明显增长就没事。平时养成良好的生活习惯，不要熬夜，适当锻炼，增强体质。
由于卵巢囊肿手术后容易出现反复发作，因此预防和治疗非常重要。
1.日常要有规律的作息时间，保持好的生活方式，避免出现一些基础疾病。
2.要有良好的心理状态，避免出现激素失调。
3.做好避孕，以免进行人工流产手术。
4.日常生活中要多做运动，同时要保持月经期间的清洁卫生。
5.要有规律的检查，以便及时掌握身体情况。
患者想要有效预防卵巢囊肿的复发，要注意改变生活方式，不可以经常吃刺激性的食物，比如葱、辣椒等，这些食物可能会导致身体激素分泌水平紊乱，从而导致卵巢囊肿。
患者注意尽量避免使用激素类的药物，可能会导致卵巢囊肿，要尽量采取科学性的生活方式，平时注意心情，保持良好的心态，还要注意从压力方面进行调理，还要养成良好的生活习惯。
如果是遗传导致的，或者存在手术不完全的情况，卵巢囊肿容易复发；但其它情况一般容易复发。
卵巢囊肿是否会复发主要与遗传因素有关，某些患者的体质本身就比较容易形成囊肿，因而术后卵巢囊肿复发的概率也较普通人更大。同时如果手术过程中选择的是卵巢囊肿剔除术，囊壁剔除的不完全，有残留的话，则很有可能出现术后囊肿复发。
此外，如果不存在上述情况，卵巢囊肿一般不容易复发，注意复查即可。