一般情况下，五岁男孩发烧39度，可以通过药物治疗、物理治疗、日常护理等方法进行治疗。具体分析如下：
1.药物治疗：五岁男孩发烧39度，属于高热的范畴，家长可以在医生的指导下使用布洛芬混悬液、对乙酰氨基酚混悬滴剂、小儿豉翘清热颗粒等药物给宝宝治疗。
2.物理治疗：五岁男孩发烧39度，可以用冰块冷敷额头、温水擦浴、贴退热贴等，达到物理降温的效果，但要注意的是，退热的同时要观察孩子的精神状态。
3.日常护理：平时多带孩子进行体育锻炼，具有增强体质的效果，还要多晒太阳。
尽量反复擦拭腹股沟区，颈部，腋窝，肘窝等大血管处，拍打式擦试按摩。注意补水，擦拭后3O分钟测体温并注意少量多次饮水，给予物理降温，物理降温，也就是用温水连续擦拭额头颈部，腋下等大血管丰富的部位，勤测体温。
宝宝现在体温处于高烧状态，需要给宝宝口服退热药物，口服退热药物以后要观察宝宝的手脚，宝宝手脚发凉的话，宝宝正处于体温的上升期，过一会体温比现在要高，需要给孩子适当多喝一些热水，进行保暖，宝宝手脚发热，采用物理降温的方式，多喝热水，也可以用温水擦浴，在额头上敷冷毛巾，洗温水澡，反复地出现发热或者体温正常以后，孩子精神状态不好，那就需要就医了。
发烧39度要用退烧药物或者物理降温的方法来退烧，可以选用非甾体抗炎药进行退烧，使用冰敷的方法，冰敷在腋窝下和额前，使用酒精擦浴的方法，同样在额部和腋下以及大腿内侧进行退烧。
考虑是病毒性感冒的情况，可以服用感冒灵同时也是要服用退烧药物，采用物理方法降温，多喝水，另外也是要注意保暖，一周左右可以恢复，必要时可以抽血检查下血常规来确定。
一般情况下，小孩发烧39℃不退高热的一种，可能存在细菌感染、病毒感染。社区获得性肺炎治疗药物主要为阿奇霉素和红霉素类药物。也可以在医生指导下退热药物进行治疗，比如阿司匹林或者布洛芬等药物，这些药都能有效地缓解发热情况，但是不能马上停用。还需要观察是否到达传染区，若到达传染区则要考虑传染病，应及时进行隔离治疗。