如果检查已经确定是停止发育，那么就需要马上按照稽留流产的方式处理，是需要清宫的，越早处理对于子宫的伤害也就会越小一点的。如果明确诊断是胚胎停止发育就应该及时进行清宫术终止妊娠如果还是不确定的情况下就暂时保胎治疗一周后复查如果还是没有胎心胚芽就可按照胚胎停止发育进行手术终止妊娠。
胚胎停育应该及时的去医院做相关的检查，明确病因对症治疗。因为是有生殖内分泌原因，是黄体功能不全，多囊卵巢原因有关系的，也会有男性的精子质量。还有子宫和卵巢功能问题，子宫大小是否有异常，异常的细菌性感染或者衣原体问题。
胚胎停育的原因主要有四个方面。生殖内心泌方面，因为胚胎早期发育的时候，需要三个重要的激素水平，分别是雌激素，孕激素，绒毛膜促性腺激素，如果母体自身的内源性激素不够，就满足不了胚胎的需要，就会造成胚胎的停育；生殖免疫的问题，如果自身有某种抗体，就会抵制胚胎的发育等。
胚胎停育的前兆主要有阴道出血、腹痛、妊娠反应逐渐停止、基础体温下降，如果处于孕中晚期，症状主要有胎动逐渐减少，没有胎动。孕期内分泌有问题也会直接影响到胚胎发育，因为受精卵着床发育成为胚胎，然后再发育成为胎儿，都需要黄体功能来维持，内分泌有问题，黄体酮分泌也会异常。
在排卵前2到3天及排卵后1天受孕流产率就低，在排卵前要减少性生活并做好孕前准备—体质、心理、环境等准备。对胎停育的预防中医中药调治很重要。不能因为西医检查正常就不予重视、理会、治疗，而发生再次胚胎停育的不良结果。所以，孕前必要的基础调治及孕后安胎养胎调理是必要的。